口授這個命令之後，拿破崙就啟程前往耶拿；下午三時，當快接近該城時，他接到蘭納斯送來的報告，說在該城上方的高原，已經有了敵軍12,000人到15,000人。拿破崙立即命令勒菲弗爾率領近衛軍進向耶拿；蘇爾特和內伊也盡最大的速度趕往那裡；而達武則從勞姆堡出發以迂迴敵人左翼。接著拿破崙繼續向耶拿進發，四點鐘稍過一點，在南德格拉芬堡與蘭納斯會合在一起，以後這個地方改名為拿破崙斯堡。
一旦到達該地，拿破崙根據他所能看見的情況，得出了一個錯誤結論，認為普軍的意圖是想在這個高原上接受會戰。所以他決定把蘭納斯的全軍和近衛軍，都送上這個高原以釘住敵軍，其次再分配兩個軍去釘住敵人的側翼，而達武和貝爾納多特的兩個軍則乘機打擊敵軍後背。
雖然取道繆爾沙爾可以迂迴南德格拉芬堡，這也是耶拿-魏瑪公路所通過的地區，但是從耶拿城卻只有一條小路可以通行。這條小路很窄，雖然步兵可能通過，可是炮兵和車輛卻無法通過。於是工兵立即奉命去拓寬較窄的部分，拿破崙親自提燈在那裡監工。當他親眼看到第一輛炮車通過之後，他又趕回南德格拉芬堡，並命令把他的御營安置在近衛軍所組成的一個大方陣的中央，這個地點現在還留有一塊&ldo;拿破崙石&rdo;做為紀念。從那裡他可以看見霍恩洛赫的營火閃閃發光，占據了大部分的高原。較遠還可以看到不倫瑞克的營火和艾卡特斯堡的敵壘。這個景象更使他確認普魯士全軍並不想撤退，而且有準備會戰的意圖。
接著在營火照耀下，拿破崙又口授命令決定第二天上午的行動：他的目的是要在高原上獲得足夠的空間，以便展開兵力，並且在10月15日以前避免決戰。他命令奧熱羅從卡拉前進，取道繆爾沙爾迂迴托恩欽的右翼；蘇爾特則從吉格進到本斯提德，再向克羅斯維茲躍出，打擊托恩欽的左翼；至於內伊和繆拉則迅速前進支援蘭納斯。（註：在這個命令中未曾提及任何村落名稱，可能的原因是營火光線太弱，使他無法看清地圖。）
由於認為普魯士全軍會向他發動進攻，所以在夜裡十時，拿破崙又指示布歇命令在勞姆堡的達武，於10月14日清晨向阿波達推進，然後從側面或後方攻擊敵軍。在這個命令中有一段是這樣的：&ldo;如果潘提阿爾弗公爵和你在一起，那麼你們可以一同前進。不過皇帝卻希望他已經到達指定給他的位置，即多恩堡。&rdo;達武於上午三時收到了這個命令。
霍恩洛赫的的敵情判斷也是完全錯誤的。他絕沒有懷疑到他所面臨著的竟是法軍的主力。他相信敵人是只在南德格拉芬堡和勞姆堡，留下一個側衛做為掩護，而主力肯定正向萊比錫和德勒斯登趕進，所以他覺得目前並無危險。
10月14日的上午異常寒冷，在日出之前，拿破崙開始出發視察蘭納斯的部隊。濃霧掩蓋著整個高原，不得不由侍衛人員舉著火把隨護，皇帝騎著馬從一個單位走到另一個單位，與軍官和士兵談話，鼓勵他們，並且告訴他們說，普魯士人今天的處境，正好比一年前奧地利人在烏爾姆一樣窘迫。他每到一處，部隊都歡聲雷動，高呼皇帝萬歲！雖然霧很濃，可是敵人前哨的距離很近，所以他們可以看見火把的光輝。當聽到法軍的歡呼時，薩克森部隊不禁為之戰慄。
上午六時，拿破崙發出攻擊令。在濃霧掩護下，舒切特的師從右面進向羅斯維茲；加桑的師從左面進向柯斯佩達。到八點半鐘，這兩個村落連同魯茲羅達，都已落入他們手中。半小時後，在舒切特的右面，蘇爾特的領先師也從羅本斯提德出現，向柴維提勒森林挺進，在那裡面對著霍爾曾多夫。同時，在加桑的左面，奧熱羅的領先師也取道繆爾沙爾前進，達到弗羅堡，以便展開在加桑師的左面。所以到了大約九點時，當霧開始消蝕時，拿破