妖魔鬼怪事件完结之后，白婷等人也纷纷飞升仙界，连武战都成功渡劫跟随众人一同飞升而来，但是得知夜星璇和于博一战险些身死，她们也是担忧不已，埋怨了夜星璇好久，但是夜星璇却感到无比的幸福……
转眼三年之后，在这三年中天界变化非常之大，原本自封天帝的于博一直都没有找到踪影，纵使夜星璇将神识遍布三界六道，都没有感受到于博的气息，这让夜星璇觉得于博应该是趁着虚空破碎之际发现到了时空通道，而开天神斧也是少数几件能够直接破开虚空进入时空通道的神器，于博很可能就进入其他世界躲避夜星璇的追捕。
失去了天帝，天界群龙无首，众人一致推举夜星璇为新任天帝，而夜星璇也当之无愧的成为天界第一，这个天帝一职也是非他莫属，反正伤势还未复原，闲来也是无事，在众人再三推举之下，夜星璇也是当仁不让，成为众人公推的第一位天帝。
接下来夜星璇便利用了三年的时间开始整顿仙魔两界，首先是设置仙魔两界的高层领袖，正所谓群龙不能无首，天界之大让人难以想象，单就仙魔两界就不是一个人能够管理的过来，因此夜星璇依旧下设了仙帝和魔尊两大顶级职务，魔尊由魔荼担任，虽然魔荼的修为在魔界称不上第一，但是他的人品、他的忠心足以让他胜任此职，再说他是夜星璇的亲信，无人敢不服。
而仙界的仙帝一职便有鲲鹏担任，同样的鲲鹏虽然修为不是最强，但是他和魔荼一样，不仅对夜星璇忠心耿耿，而且人品绝佳，担任仙帝一职非常适合。
然后仙帝和魔尊之下各设立八大仙魔君王，仙魔两界都被平均分成了八大部分，这与原来的仙界四分以及魔界八分略有不同，特别是仙界版图改变巨大，当然这仙魔两界******仙魔君王也基本都是夜星璇最信得过而且人品都是上乘之人，夜星璇选人修为并不是第一位，只有心性人品绝佳才能够胜任。
而夜星璇的眼光却也是非常独到，凡是他选拔上来的仙魔领袖皆能干出一番令人津津乐道的大事，将各自管辖的区域管理的井井有条、红红火火，短短数年时间众人便安居乐业，整个天界包括人间界和鬼界都一片和平繁荣景象，达到前所未有的安宁祥和，这才是人人向往的理想天界。
又过了五年，夜星璇的伤势比想象中恢复的要快上不少，因为他待在以前苍穹宫的太乙玄天木中进行修炼，将天地五灵之最中的最后一种元素吸收炼化，不仅伤势完全复原，而且实力也有明显的提升，在这五年间夜星璇除了继续探查于博的下落便是想方设法重新开辟吞噬仙魔谷，在耗费数年之力，与佛宗众位前辈合力之下，吞噬仙魔谷终于恢复到正常状态，佛宗弟子全部移居入住，夜星璇也总算了啦一桩心事。
但一直有一件事情让夜星璇忧心忡忡，那便是于子琪，本来以为于博在战斗之前会将于子琪留在于博宫，可谁知道于博消失了，连于子琪的遗体也不见，这不仅让夜星璇担忧至极，更是让姬雪雁时常哭的犹如泪人，失去心爱之人的痛苦只有当你失去了才真正能够体会，夜星璇那是深有体会的，所以他决定纵使不去寻找于博，也要将于子琪寻找到并让他起死回生。
因此，这个世界的事情解决完之后，夜星璇毅然决定重新踏上三千大世界的征途，目标有二，其一继续寻找各界高手以力证神；其二寻找于博父子，夺回开天神斧和补天神石复活于子琪。
带着这两个目标，夜星璇又重新开始了他新的征途，只不过这一次夜星璇并没有带上所有东胜宫之人，以前那是逼不得已，现在三界已经安宁平和下来，所以夜星璇只是将身边几位至亲好友带上，其他之人继续留在这个世界发展。
这天，夜星璇告别三界所有众生，留下云凡担任东胜宫新宫主留守天界，武战进行辅佐，而他自己则带上白婷