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当时天还未明，崇桢帝听到消息，命周皇后饮毒酒而死，又命张太后自缢，之后崇桢帝在一座名为煤山，又叫景山或万岁山的人工山上 的一棵树上上吊而死，陪伴他的一个叫王承恩的太监也随后上吊而死。他在自缢之前，留下一份遗书： 逆贼直逼首都，固是由于我的品德不足，上天才降下惩罚，但也是群臣误我。我死后无面目见列祖列宗于地下，请去掉我的帽子衣服，把头发披到我的脸上。任凭逆贼割裂我的尸体，但不要杀伤我的臣民一人。崇祯帝在位17年，死时年仅35岁。明朝建立于公元1368年，洪武元年，结束于公元1644年，崇祯17年，共存在276年。当初明成祖朱棣给自己的子孙排的辈分是20个字：高瞻祈见佑，厚载翊常由，慈和怡伯仲，简靖迪先猷。但到朱由检就已经结束，只传了十代。崇桢帝共有六个女儿和七个儿子，六个女儿当中有四个早死，另两个活下来的是长女长平公主和*昭仁公主。崇桢帝在自杀前，对长平公主说：“你为什么生在我的家里？”然后挥剑砍去，砍断长平公主的左臂，长平公主昏死过去，之后又砍死了昭仁公主。一个太监把长平公主抬到了她的生母周皇后的父亲周奎家中，几天后苏醒，一直无人知晓她的下落。在顺治年间，长平公主给顺治帝上疏，要求准许出家，顺治帝不许，将其嫁给周显，周显本是长平公主的父亲崇桢帝为其选定的驸马，并赏赐给土地和金钱。第二年，长平公主病逝。崇桢帝的七个儿子中，除皇太子也就是皇长子、皇三子和皇四子活下来以外，其他四子都已早死。崇桢帝死后，三个儿子躲藏起来，被李自成的军队搜获，李自成封太子为宋王，之后带领三人征讨吴三桂，以后三人便下落不明。
在北京陷落的同年，张献忠进入四川，占领成都，建立“大西”政权。当初在抗击张献忠起义军的时候，国库无钱，崇祯帝要求皇亲国戚和大臣百官捐钱助军费，无人肯捐，崇祯帝强迫，几个皇亲勉强捐出很少，连太监也说，“皇亲如此，国事去矣！”。在战争期间，官兵不敢出去作战。有一个副总兵，不敢出战，受了压力，出战了，大胜回来，但是“出斩五千级，验之皆妇女首”，斩了五千个平民妇女的头颅回来交差。
经过十三年的战斗，李自成终于攻占了北京，把大顺政权由西安迁到北京。明政府的文武官员纷纷投降，李自成继续任用这些官员。但李自成和他的部下被胜利冲昏了头脑，山海关仅派去几千名士兵镇守来抵抗清兵，其余几十万士兵在北京城里抢掠民财，尽情享乐，军纪大乱。
当时明政府的一支最强劲的边防军，由蓟辽总兵吴三桂率领着从他的边防驻地宁远正向北京驰援。这时李自成派人去招降吴三桂，吴三桂对明朝已经失去信心，接受招降，准备带领军队到北京拜见李自成，他的在北京城的父亲吴襄正好也派遣仆人劝他投降。但经过下列一段对话后，吴三桂的态度立刻转变。他问他父亲及家人的情形，仆人说：“已被逮捕。”吴三桂说：“我到北京后，就会释放。”又问他的财产，仆人说：“已经没收。”吴三桂说：“我到北京后，就会发还。” 又问他美丽的爱妾陈圆圆，仆人说：“已被李自成的宰相刘宗敏抢去了。”吴三桂火冒三丈，下令他的军队为死去的崇祯帝穿上白色丧服，誓言为崇祯