阿弥陀佛闻言笑道：“善哉！善哉！师弟此言大善，弥勒，去请药师菩萨到此。”
弥勒领命出去，过一会儿带着一位佛陀进来。那佛陀名号药师，正是那药师佛，向两位教主施礼。阿弥托佛道：“药师菩萨（此前药师道人修为是佛陀，但未称佛），你今有缘，可转世进入十恒河沙国土以外的东方，为我佛教建立佛界，成为佛主。”药师菩萨大喜，忙道：“我佛慈悲！南无阿弥托佛！”
阿弥陀佛为药师菩萨亲授印记，抚顶道：“善哉！善哉！入得东方，立下大愿，南无琉璃光王佛！”
药师菩萨忙许下大愿道：“愿我来世，得菩提时。若诸有情。众病逼切。无救无归。无医无药。无亲无家。‘贫穷多厄。我之名号。一经其耳。众病悉除身心安乐。家属资具。悉皆丰足。乃至证得无上菩提。愿我来世。得菩提时。若有女人。为女百恶之所逼恼。极生厌离。愿舍女身，闻我名已。一切皆得。转女成男。具丈夫相。乃至证得无上菩提。愿我来世。得菩提时。令诸有情。出魔脱纲。解脱一切。外道缠缚。若堕种种恶见稠林。绵当引摄。罩于正见。渐令修习。诸菩萨行。连证无上正等菩提。愿我来世。得菩提时。若诸有情；王法所加。缚录鞭挞。系闭牢狱。工当刑戮及余无量灾难凌辱。悲愁前逼。身心受苦。若闻声名。以我福德威神力故皆得解脱一切忧苦。善哉！善哉！南无阿弥托佛！南无琉璃光王佛！”说完合掌微笑，身躯涅磐，化为一颗斗大舍利，离了极乐世界向东方飞去。
如来出身上清圣人通天教主截教，后得太清圣人太上老君教导太清圣人大法，又有燃灯与迦叶教导玉清圣人大法以及那西方佛教圣人大法。因此，如来也就成为了天地间唯一一个通晓三清圣人大法与那佛教圣人大法之人。声名之盛，三界无两。
多宝证得如来佛祖后，命文殊菩萨、普贤菩萨两人做为协侍菩萨。如来又收了两名亲传弟子与十名记名弟子，亲传弟子乃是迦叶与金蝉子二人，迦叶当日为保护如来而身死投胎，如来自然要偿还此番因果。
那金蝉子却是一只知了，如来当初在菩提树下听燃灯，迦叶二人讲道时，有一只知了远远的飞来落在那菩提树上，日夜和如来一起听道，那化身菩提树的准提圣人没有阻止，其余二人自也不会与那知了为难。如来得到后，便点化了那只知了，收为门下第二弟子。
如来的十名记名弟子乃是当初释迦牟尼得道前的十位忠心耿耿的侍卫，这些年来也一直旁听着文殊等三人讲法。分别为：一、大迦叶，二、舍利弗，三、目连，四、须浮提，五、富楼那，六、迦旃延，七、阿那律，八、优波离，九、阿难，十、罗侯罗。十人各有所长，倒也有一定本事。
如来身具诸家之长，借鉴于太上老君的〃一气化三清〃之术，却加诸了改变，以诛仙阵图斩化忿念，分别用三清圣人大法和佛教圣人大法演化了五具分身，名为五方明王，分别为中央不动明王、大威德明王、军荼利明王、降三世明王、金刚夜叉明王。
如来又从那准提所度回的三千佛陀中选了十八位优秀者，称为十八罗汉。
如来归位后，佛教横三世佛（药师佛、如来佛、阿弥陀佛）、竖三世佛（燃灯为首的上古七佛、现在如来佛、未来弥勒佛）、三身佛（法身毗芦佛、汉、三千佛陀尽皆齐全，佛教实力之强，三界无两。
燃灯又用那重赵公明手中夺得的阴阳珠演化了佛教的两重天，实际上分为20诸天，共有三千佛国。至此佛教诸佛已将近圆满。
如来引进了截教〃有教无类〃思想，和接引准提的〃修身度己〃结合起来，取长补短，发展成为大乘佛教〃修己度人〃思想，完善了佛教教义。历史上每每遇到战乱时期，百姓困苦，精神无从寄托，佛教地〃西方极乐〃对百姓的引诱力自然不是其它教