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大部分降将都做了安排，当然也有些降将不好安排，比如刘良佐、李本深二人，他们在南明朝廷己分别位居广昌伯、左都督，多铎不愿意正式承认他们的这些官职，但若是授予他们总兵之类的新官衔，则又相当于将二人降职，势必会引起他们的疑惧，后果相当难料。于是，多铎采取了一个临时性安排命令刘良佐、李本深暂时“以原官从征”，回避了对他们的正式任命。
当然对这些降将的委任需要摄政王多尔衮的正式同意，多铎把任命建议连同报捷文书一起送往北京。
得知自己没有降职之后，众降将都安了心，于是多铎宣布进行裁军，各将所部骑兵一律保留，步兵着情裁撤。新招募久离家乡者，通查明白，准归本籍，其水师及战船，仍著领兵官照旧修理，用心操练。也就是只保留骑兵精锐步兵以及水兵等技术兵种。
经过裁撤之后，各将所属兵力大减。拿总兵李成栋来说，原有兵力一万余人，裁撤之后仅余三千四百人。李成栋是高杰属下重将，其部战斗力在江北四镇中首屈一指，他尚且如此，其他各将兵力裁撤的更厉害。一般而言，各将剩下的兵力多则一两千，少则五六百。
经过裁撤之后，各将属下兵力大幅减少，由二十多万降到了不足十万。可是还是裁掉老弱新兵之后，战斗力却更胜以前。
裁兵之后，多铎把地位最高、潜在危险性最大的人如李本深、刘良佐部留在了南京附近，以便南京城中的八旗军能够随时监控这些人。
而对李成栋、田雄这些地位稍次的悍将，则放心使用，将他们派往战事第一线。不过，这时的四镇降军们根本没有反清的能力。在南京和杭州驻扎的八旗军是清廷在江南进行统治的军事基础，有他们在，降军们绝不敢轻举妄动。
而更重要的是，四镇降将们此时已不再是“藩镇”，失去了对地方行政权与财政权的控制，无法再像弘光时代那样私自聚敛甚至劫掠钱财，他们的部队所需的粮饷完全依赖于清朝当局的定量供应。同时，手中兵力有限的降将们也无法再像从前那样自行募兵，扩大势力。这样，降将们失去了跋扈的本钱，只得乖乖地听从清廷的调遣。
完成了绿营兵裁撤降将任命部署之后，多铎开始第二件事，那就是颁布剃发令。
其实早在南京被阿济格攻陷的捷报传到北京，满清摄政王多尔衮以为天下大定了，于六月初就悍然下令全国男性官民一律剃发。并传令南京，命令“各处文武军民尽令剃发，倘有不从，以军法从事”。
现在杭州攻陷，各地纷纷投降，多铎认为是颁布剃发令的时机了。在多铎看来，整个江南的士绅百姓都雌伏在八旗兵的淫威之下，正是颁布剃发令的最好时机。
多尔衮和多铎们永远也意识不到，清兵伐明如此顺利不是因为他们太强大，而是对于绝大多数大明百姓来说，根本就没有家国概念。明也好，清也罢，不过是换个朝廷，换个缴纳税赋的对象而已。占人口绝大多数的农民和相当一部分官绅地主生活居住在农村，他们同朝廷、官府的关系主要表现在照章输赋服役，一辈子没有进过城的百姓多得很，中央朝廷的更迭对他们来说是天高皇帝远。只要不被朝廷、官府逼急了，就不会起来闹事，就是所谓的“承平之世”。
一旦严令剃头，等若朝廷的威严直接加到自己脑袋上，其后果可想而知。身体发肤授之父母岂可轻易剃掉？数千年汉民的传承又岂是区区一纸剃发令轻易改变？剃了头发，岂不是由汉人变成了蛮夷？
结果剃发令一出，不仅原先准备降清的人立刻改弦易辙，就连已经归附的州县百姓也纷纷揭竿而起，树帜反清。
多铎没想到剃发令颁布的后果如此严重，犹如一石激起千层浪，江南各地立刻