去世后，他的两个弟弟忽必烈和阿里不哥展开了汗位争夺。忽必烈在开平称汗，阿里不哥在和林称汗，双方爆发内战。这场内战不仅使蒙古帝国东部陷入分裂，西部的旭烈兀和术赤家族的别儿哥也因宗教等问题爆发冲突，蒙古帝国彻底陷入混乱。
2. 经济基础差异：
蒙古帝国疆域辽阔，不同地区的经济发展水平和模式差异巨大。中原地区、西亚地区、东欧地区等都有各自的经济体系和特点。例如，中原地区以农业经济为主，有着发达的农业生产和商业贸易；西亚地区则是重要的商业和贸易中心。各地区在经济上的独立性较强，缺乏紧密的经济联系和统一的经济管理，难以形成强大的经济凝聚力来维系帝国的统一。
随着蒙古帝国的扩张，对各地区的经济掠夺和剥削也日益严重，这引发了当地人民的不满和反抗，进一步削弱了帝国的统治基础。
3. 文化差异与隔阂：
蒙古帝国统治的地区涵盖了众多不同的民族和文化，包括汉族、伊斯兰文化、基督教文化等。不同文化之间的差异和冲突难以避免，例如在宗教信仰、风俗习惯、价值观念等方面存在着很大的不同。这种文化上的差异使得帝国各地区之间的认同感和凝聚力较低，难以形成统一的文化认同和国家意识。
蒙古统治者在文化政策上也存在一定的问题。一些统治者试图强制推行蒙古文化，忽视了其他民族文化的存在和价值，这引起了被统治民族的反感和抵制，加剧了文化上的矛盾和对立。
4. 地缘因素：
蒙古帝国的疆域过于庞大，地域之间的距离遥远，交通不便，通信困难，这使得中央政权对地方的管理和控制难度极大。中央的政令难以迅速传达至各地，地方的情况也难以及时反馈给中央，导致地方势力容易形成割据局面。
各地区的地理环境和资源分布也不均衡，一些地区拥有丰富的资源和优越的地理位置，而另一些地区则相对贫瘠和偏远。这使得不同地区之间在经济利益和政治地位上存在着竞争和矛盾，进一步加剧了帝国的分裂趋势。