在解决了内部因高级文明带来的问题后，“宇宙联盟”继续在宇宙中稳步前行。然而，新的危机却在不知不觉中悄然逼近。
一次，“宇宙联盟”的巡逻队在边境星系发现了一些异常的能量波动。这些波动不同于以往任何已知的自然现象或科技产物，充满了神秘和危险的气息。林川立刻召集了联盟内的顶尖科学家和战略分析师，共同研究这些能量波动的来源和可能带来的影响。
纲手提出，这些能量波动可能会对周边星系的生命形式造成未知的生理影响，需要提前做好医疗应对准备。大蛇丸则推测，这或许是一种前所未有的强大武器在进行测试所产生的能量泄露。
为了弄清楚真相，林川决定派遣一支由精英战士、科学家和技术专家组成的特别行动小组，深入波动源头进行调查。小组在穿越多个星系的艰难旅程中，遭遇了各种宇宙射线的干扰和星际物质的阻碍。
但在林川的远程指挥和小组成员的紧密协作下，他们终于接近了能量波动的核心区域。眼前的景象让他们震惊不已，一个巨大的人造结构体悬浮在太空中，不断释放出强大的能量脉冲。
行动小组试图靠近结构体进行更详细的观察和数据采集，但结构体周围存在着强大的能量护盾，阻止了他们的接近。小组中的科学家们开始对护盾进行分析，寻找突破的方法。
与此同时，“宇宙联盟”内部也在紧张地进行着各项准备工作。纲手组织医疗团队研发针对可能出现的新型伤害的治疗方案和药物。大蛇丸则带领技术团队，根据行动小组传回的数据，尝试开发能够破解结构体防御的武器和工具。
经过艰苦的努力，行动小组的科学家终于找到了能量护盾的频率弱点。在“宇宙联盟”总部的技术支持下，他们成功地突破了护盾，登上了结构体。
然而，结构体内部的情况更加复杂和危险。充满了未知的科技设备和错综复杂的通道，似乎隐藏着无数的秘密和陷阱。行动小组在探索过程中，不断遭遇各种自动防御系统的攻击。
一名队员在躲避攻击时不幸受伤，生命垂危。小组中的医疗兵迅速采取急救措施，但常规的医疗手段效果甚微。纲手通过远程医疗指导，利用最新研发的医疗技术，成功稳定了队员的伤势。
在继续探索的过程中，行动小组发现了一些关于结构体的重要线索。原来，这个结构体是由一个名为“暗能军团”的神秘组织建造的，他们企图利用这种强大的能量装置控制整个宇宙。
林川得知这一消息后，决定加快行动步伐，抢在“暗能军团”启动装置之前摧毁它。大蛇丸根据行动小组获取的信息，成功制造出了一种能够干扰结构体能量核心的装置。
行动小组携带干扰装置，深入结构体的核心区域。在与“暗能军团”的守卫激烈交战后，终于成功安装了干扰装置，使结构体的能量输出陷入紊乱。
但“暗能军团”并没有坐以待毙，他们派出了大量的增援部队，试图夺回结构体的控制权。林川果断下令，派遣“宇宙联盟”的主力舰队前往支援行动小组。
在激烈的太空战斗中，“宇宙联盟”的舰队展现出了强大的战斗力和顽强的意志。但“暗能军团”的武器和战术也非常先进，给联盟舰队造成了不小的损失。
纲手带领医疗舰队在战场后方忙碌地救治伤员，确保舰队的战斗力得以持续。大蛇丸则在指挥中心，根据战场形势不断调整战术和武器配置。
经过一番殊死搏斗，“宇宙联盟”最终成功摧毁了结构体，挫败了“暗能军团”的阴谋。但这场战斗也让“宇宙联盟”元气大伤，许多战舰受损，大量人员伤亡。
战后，“宇宙联盟”开始了漫长的重建和恢复工作。林川制定了一系列的发展计划，旨在提升联盟的军