说无非是场面之词而已。热热闹闹的宴会散去，回到寓所的他便召集着诸人开会，所说的就是杭州一案。
官司缠身的孙汶担心着杭州之事彻地曝光，真如此。不要说同盟会，就是他的名声也是臭了；而同样官司缠身的杨锐只把韩玉秀的案子当做一种解脱，前一次整肃死的那些人虽然正了名。但他心中犹有一身感觉，良知告诉他这样做的还不够——把人弄死了，正个名就好了，在算什么事？这次审判正好可以给他一次彻底洗清的机会。如此他心中也好受些。带着这样的想法。他根本就没有和人商议案情，只是把心思放在其他地方，比如说运输。
运部是除工部之外是总理府各部中最庞大的部门，它不但管理铁路、还管理公里、水路、电信电报、邮政，最后还有航空运输，这些东西放在后世完全是可以独立成为一个部门，但现在杨锐故意的把他们整合在一起，统称运部。
部门分的越多。工作做的也就越细，对于技术来说。这是好事，但对于物流来说这未必是好事，在他看来，全国的物流必须是综合全面考虑的事情，不能铁道部只想着修铁路，公路局只想着修公路，如此的分工虽然会让各种运输方式互相竞争，但更会彼此内耗，所以全国的物流必须统筹起来，绝不能各自为政。
这是杨锐对于物流部门工作安排的看法，而对于物流本身，他则喜欢水路而非铁路，也就是说，全国的运输网最基础的是水路运输，而后才是铁路运输，最后是公路和航空补充。
负责运部的盛宣怀对于他的观念无法理解，特别是杨锐把河流的运输作用放在灌溉和水电之上，比如他禁止农部使用黄河水灌溉，也禁止在黄河以及长江上修水电站，这是完全让人无法理解的，但杨锐就是这样命令的，而且没有解释原因，弄得农部的陶成章以及土部的水利负责人武同举很是尴尬。不但如此，杨锐还下了禁令，即华北、西北地区永远不得使用河水灌溉，同时任何河流，只要会影响航运，就不得修筑水电站，再有就是一切桥梁修筑不得影响航运，特别是长江。
杨锐这三道不近人情的命令只让人牙疼，但是没办法，他是总理，陶成章也好、武同举也好、甚至盛宣怀也好，只得领命。其实杨锐如此下令，也是因为后世经验以及地摊文学的影响：经验者就是灌溉，后世西北华北引黄河灌溉的不少，弄了不少所谓的塞上江南，但结果便是灌溉引起地下水位上升，土地盐渍化几十年也难以治理；而地摊文学则揭露长江各大桥影响航运、三门峡水电站祸国殃民、三峡大坝建成库体就开裂等等谣传信息之类。
如此的熏陶只让杨锐对水电站和大桥很厌恶，这才认定于河流除了治理水患外，其主要的作用就是航运，灌溉和水电完全靠边。上有所好，下必甚焉，运部很快就按照‘河运为基、铁路为干、公路为补’的思路拿出了全国运输网草案。
河运：横向从北到南为黄河、淮河、长江三条；纵向其实并没有一条可以联通的大河，在东北只有黑龙江、华北华东是京杭大运河以及钱塘江、而华南则是珠江。为此，杨锐不顾京杭运河已经淤塞的事实，为了让全国有一条纵向河流，居然要在赣江和珠江水系之间开凿一条运河，运河不长，只有几十公里，但工作量却是巨大，即便忽略技术因素强行开凿运河，其所耗费的资源也不是现在国力能够承受，幸好这只是全面长期规划，并不是说现在就要开挖，这才让盛宣怀放下了心，但多了这么一个要长期投资维护的河运网，詹天佑等铁路派还是很忧心修铁路的资金不够。
河运虽然是运费低廉，但除却河道维护费用高昂外，依然有两个问题：其一，国内河运船只不够，根据统计。即便是算上几十吨的小船，全国也只有不到五万吨的运量，而且这些船大部分是帆船。所以即便是修了河道码头，也不能有效利用这些河道；其二