7月1日，軍事委員會發布了一項動員令。9日，革命軍舉行誓師大會並批准了一項關於北伐目的的宣言，其內容是：&ldo;在&l;三民主義&r;的基礎上建立一個獨立的國家；保護國家和人民的利益。&rdo;
當所有這些事情都已辦好且北伐已實際上開始的時候，出現了一股反對浪潮。廣東的總罷工失控了。工人糾察隊每天都與警察發生暴力衝突，結果造成了警察官員的辭職。蔣採取行動，派軍隊增援警察巡邏，並派秘密人員監視專門進行鼓動的人。
於是，出現了一些值得注意的情況。商總會似乎不再願意交納用於資助北伐的稅款，蔣使商人們相信，他們最大的利益將通過交款來實現。而這筆款總數是50萬元。商人們最後交了款，罷工者們也認識到，他們對北伐所能做的貢獻就是出4000苦力，而且他們這樣做了。
雖然，蔣不在前線，革命軍還是旗開得勝，於1926年7月12日，一舉占領長沙。蔣最後於7月27日離開廣東，前去指揮他的軍隊。當他的新編軍隊加入戰鬥的時候，其總數已從8．5萬人增加到大約10萬人，廣西和湖南的軍隊也加入了蔣的行列。
根據蘇聯的建議，各級都派了政治委員，以便向每一個士兵宣傳&ldo;三民主義&rdo;，無疑其中也夾雜著馬列主義。
這些士兵認識到他們是為什麼而戰，這使他們增添了戰勝軍閥軍隊的優勢。如果他的軍隊情緒波動，他可以採取嚴厲的紀律措施。任何臨陣脫逃的軍官，不論其級別如何，都會被立即槍決；如果一個軍團的司令堅守陣地而戰死沙場，而他周圍的人退卻的話，那麼，該軍團所有師長都要被處決。這條紀律同樣也適用於下級部隊。無疑，這種嚴厲的措施，鼓舞了革命鬥志。
然而，一開始就使蔣受到下級愛戴是不太可能的。另外，在非公開的場合，他也沒有受到普遍的愛戴。他自己直接指揮的部隊按時發軍飽，並且裝備比其他部隊要好。其他部隊對他的歧視很不滿意，但是，勝利來得如此之快，以致於幾乎不需要嚴厲苛刻的紀律。同時，部隊的條件也從總體上得到了改善。
這是一支徹底的用政治武裝起來的部隊，每個軍團都有國民黨機構和黨員，而且都受過軍事訓練，對其他軍官具有絕對的權威。財務帳目也向每一個人公開，以杜絕敲榨勒索和貪污現象。
雖然軍閥的部隊與革命軍在數量上占10比1的優勢，並且裝備精良，習慣當地水土，但是，他們不團結，舉止粗野，並且容易叛變。
在中國漫長的歷史上，國民革命軍是一種新型的軍隊。他們充滿信心，並由於取得了巨大、迅速的勝利而士氣高漲，隨著不斷地向北進軍，隊伍也隨之不斷地壯大。
同吳佩孚的軍隊之間進行的最艱難的一場戰鬥是攻打武漢三鎮之一的武昌戰役，由於武昌城牆堅固，而敵軍又困獸猶鬥，所以，直到10月7日才攻下來。11月8日攻下南昌。
不久，革命軍的數量增加到26．4萬人。由於紀律嚴明，他們深受愛戴，並且美名遠揚。他們和軍閥的軍隊形成了鮮明的對比。後者每到一座城市便徵用民房，強迫當地商人為軍隊負擔2至3個月的費用，並擅自徵用當地勞力，而北伐軍則在廟字和公用建築中宿營，交付生活費用，發給士兵軍餉，並且不抓壯丁。
9月16日，信奉基督教的總司令馮玉祥從蒙古和俄國回來，加入了討伐吳佩孚和張作霖的戰鬥。至1926年底，革命軍控制了湖南、湖北和江西。在北伐的第二次高潮中，北伐軍於1927年2月17日占領了蔣家鄉的省城浙江杭州。3月22日攻克上海，24日攻占南京。至此，革命軍控制了長江流域，並且控制了華南和華中的10個省份。
然而，那年春天，戰鬥停了下來，