沉没事件。9月17日，U29号潜艇击沉英国无畏号航空母舰。10月14日，U47号潜艇潜入斯卡帕弗洛英国海军基地，击沉皇家橡树号战列舰。在此阶段，德军共击沉盟军运输船只近400艘。1939年10月，邓尼茨晋升为海军少将。1940年，晋升为海军中将。
第二部分邓尼茨 海军元帅（4）
邓尼茨视察海军部队
1941年春，盟军加强护航和反潜措施（如反潜舰、装有定向器的飞机），使德国的攻击受挫。邓尼茨及时调整部署、改变战术。一方面，坚决要求空军支援潜艇作战，首次提出航空兵与潜艇的“战役与战术协同动作是极为重要的”。经过有力交涉，希特勒命令驻波尔多的第40飞行大队在进行远距离侦察方面隶属潜艇司令部。另一方面，开始全面实施战前制定的“狼群战术”，即把30艘～40艘潜艇编成一个“狼群”，再分为侦察和突击两个艇幕。侦察幕各艇间隔30海里～40海里，突击幕各艇间隔15海里～20海里。两幕的战役纵深保持在50海里～100海里之间。稍后，邓尼茨又修正战术，将两幕分为侦察、预备进攻和突击三幕。修正后的“狼群战术”使潜艇不再躲避盟军的护航警戒舰艇和飞机，一旦发现目标，所有潜艇都浮出水面，全速接近目标，用高炮射击护航飞机，用鱼雷攻击护航舰和运输船。 由于指挥得当，邓尼茨的潜艇给盟军大西洋海上交通线带来浩劫。1941年4月至12月，共击沉盟军325艘运输船，总吨位约158万吨。美国参战后，德国潜艇的活动范围又扩展到美国海岸及加勒比海一带。1942年，德国潜艇每月击沉盟军商船近97艘，总吨位达52万多吨。整个战争期间，德国潜艇部队共击沉盟军运输船、商船2828艘，总吨位达14687231吨，击沉击伤盟军军舰115艘，给同盟国特别是英国造成极大的困难。英国海军惊恐地认为：“邓尼茨炸沉我们的商船是在慢慢地绞死我们，……他是自荷兰勒伊特以来，英国最危险的敌人。” 1943年1月，雷德尔海军元帅因在作战问题上与希特勒发生严重分歧而辞职。邓尼茨继任海军总司令，并晋升为海军元帅。
第二部分邓尼茨 海军元帅（5）
邓尼茨在研究作战计划
然而从1943年4月起，德军在大西洋的潜艇战已走下坡路，击沉商船和运输船的吨位逐月下降。尽管邓尼茨针对盟军反潜力量的加强而相应改变了战术，但是德军再也不能把握主动权了。1943年5月24日，邓尼茨下令停止在北大西洋对盟军护航运输船队的作战。 1944年7月21日1时，邓尼茨在柏林发表广播讲话，强烈谴责刚发生过的暗杀希特勒行动，表示海军一如既往效忠元首。1945年4月20日，希特勒将德军尚占据的德国领土分为南北两个地域，任命邓尼茨为北部地域德军总司令。次日，邓尼茨用飞机把1个海军营运入柏林，保护希特勒的安全。这时，纳粹德国内部分崩离析，连戈林、希姆莱都在考虑退路，第三帝国要员中只有邓尼茨和戈培尔仍然真心效忠希特勒。因此，4月30日，希特勒在自杀前指定邓尼茨继任德国总统和武装部队最高统帅，戈培尔为帝国总理。戈培尔自杀后，邓尼茨又兼任总理职务。邓尼茨在普伦接到上述任命的电报和希特勒自杀的消息后，立即通过汉堡广播电台向全国发表文告，号召德国军民继续在东线负隅顽抗，暗地指示西线的德军向盟军投降，以使战后德国有更多的人口领土能继续保留在资本主义世界里。5月2日，邓尼茨将大本营移至弗伦斯堡。5月5日，邓尼茨派海军总司令弗里德堡去兰斯求见盟军最高司令艾森豪威尔，次日又派约德尔去兰斯，再次恳请盟军接受德军投降。5月8日，邓尼茨向全国发表投降的广播文告，次日派最高统帅部参谋长凯特尔元帅签字投降。