出了些许代价。正是由于这个缘故，元军虽然在白天进行陆上作战，但到夜间就一定撤回海上。
元军方面，受伤的左副帅刘复亨被亲兵先行护卫上船。元军统帅忻都召集其余将领商讨第二天的军事部署。经过一天的对战，元军也死伤不少，可谓兵疲矢尽——《元史？日本传》记载“官军不整，又矢尽”，并且重要将领受伤，日本的有效防卫力量数倍于元军，这些不能不对不善跨海作战的元军统帅忻都产生负面影响。
高丽将领金方庆头脑冷静，他认为只要坚持苦战，便能攻克太宰府，以便保住战果等待援军再从长计议。如果元军能够顺利班师回国，这次远征无论如何不能算作失败。
关于第一批元军东征最终“失败”的原因，在日本方面的战史资料如《蒙古袭来绘词》、《八幡愚童训》中没有说明，中国《元史》对这第一次远征日本的记述也极为简短，仅有“冬十月，入其国，败之。而官军不整，又矢尽，惟掳掠四境而归……”
《高丽史》提到了“会夜大风雨，战舰触严崖，多败……军不还者，无虑一万三千五百余人”。
日本某朝廷公卿在其私人日记也提到了元军船只被海风“吹归本国”。
另外在日本其他人的奏状中也有“神风狂吹，敌兵失命”的记载。
根据这类说法，可以做出这样的推测，即就在元军决议班师回国的这天晚上，博多湾出现了台风。
日本群岛四面环海，除东北部沿海外，均被来自热带太平洋的暖流所环绕，在每年8、9、10月间，日本西部和南部常遭台风袭击；博多湾恰好位于台风的袭击区内，也就是说，就在元军滞留博多湾的最后一天夜里，台风也恰好赶到了。
日本著名历史学家井上靖赞同这一说法：“公元1274年10月初，以船舰九百艘、士兵三万三千人占领了对马、壹岐两岛……继而侵入肥前松浦郡……使日军处于不利，不得不暂时退却到大宰府附近……元军虽然赶走了日军，但不在陆地宿营，夜间仍回船舰。当元军回到船舰后，恰遇当夜有暴风雨，元舰沉没二百余艘，所余元军撤退，日本才免于难。”
美国蒙古史学者罗莎比的意见与井上靖相似，他写道：“尽管日本人得知蒙古军队已经出发，但他们的准备仍不完备……他们的武器也无法与蒙古人的长距离武器相匹敌，他们的指挥官也不如久经战场考验的蒙古军队领袖那样有经验，但他们擅长于面对面的搏斗……尽管他们在前几夜的战斗中失利，但突然降临的暴风雨使蒙古军队和船舰在退往旷海中时损害惨重，他们不得不无功撤退。”
四 元军首次东征——日本胜得莫名其妙（4）
另外，在日本江户时代的《西大寺敕谥行正菩萨（睿尊）行实年谱》中有这样的记载：“文永十一年十一月五日亥刻，猛风频吹，元之大船百余艘沉入海中之消息自西国传来”，
这一史料的推测是，海风事件是发生在元军撤退途中，而不是撤退之前。
已故日本著名史学家网野善彦做出了这样的推测：当夜确实出现台风，但并不是能够倾覆元朝远征舰队的海上飓风，但风雨动摇了劳累不堪的远征军将士的意志。
元军第一次征伐日本就此宣告结束。据统计，折损士兵近万人。
第二天早上晨光初露，枕戈待战的日军在太宰府水城列阵，但久等不见元军来攻，派出的侦察人员回来告诉日军将领，博多海面已无元军船只。
武士们几乎不敢相信自己已经胜利了。
日本内地的幕府和朝廷更不可能知道这一点。他们只知道元军已经攻陷了对马，京都笼罩在紧张惶恐的气氛中。甚至流传着九州已经失陷的流言。
差不多一周之后，京都方面才传来元军登陆博多的消息。