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发现情况不对，徐继赶紧打出旗号，命令两翼之兵冲击吴军两翼，然而早就被吓得两腿发软的清军士兵才刚磨磨蹭蹭的发起进攻，吴军那边就已经立即变阵，两支横队左右分出，保护住了掷弹队的两翼，以‘门’字形继续向前进攻。
不得不佩服徐继的应变之能，即便从没和吴军的线性战术交过手，徐继还是十分天才的立即发号司令，派遣一军迂回去抄吴军背后。然而吴军方面的反应更快，才刚发现清军迂回来抄背后，吴军掷弹筒队中马上分出一百余人，举起击针枪保护住了背后，也把吴军阵形变成了吴超越赖以扬名天下的空心刺猬阵。
是只能够滚动的大刺猬，保持着严整队形的同时，吴军刺猬阵仍然在向清军指挥部迅速推进，清军几次壮着胆子发起冲锋，也很快就被吴军的击针枪和手雷弹击退。同时被保护在刺猬阵中间的吴军掷弹手开准机会，也不断把掷弹筒炮弹轰进清军人群密集处，炸得清军士兵上窜下跳，冲锋攻势更加凌乱不堪，软弱无力。
终于，吴军刺猬阵推进到了清军指挥部的两百米处，停下脚步掩护掷弹队轰击清军指挥部，不过很可惜，聪明过人的徐继早就料到吴军士兵是想来送他回家，早早就带着部将亲兵逃离了指挥台，吴军的密集火力覆盖收效并不大，没能炸死多少清军士兵。
不过也足够了，连绵不断的爆炸声中，不但清军的指挥号令旗接连倒地，徐继的帅旗也在轰击中飘飘落地，徐继再也无法通过旗号指挥整个茅津渡战场，清军的军心士气也遭到了重创。
这时，刘坤一也带着后军发起了进攻，轻而易举的和前军联手杀溃了隔在两军之间的清军机动队，与前军汇为一股，然后立即向清军的渡口防御阵地发起进攻。
守卫渡口的清军士兵开始欲哭无泪了，他们躲藏的坚固地堡全都是面向渡口码头，只能躲在工事后对着渡口码头开枪，背后却毫无防御，从背后杀来的吴军士兵想怎么对他们开枪就怎么对他们开枪，打得他们死伤惨重，只能是纷纷放弃工事撒腿逃命，辛苦修建的坚固工事也基本上形同报废。
还有清军针对渡口修建的炮台，本来掉转炮口之后，清军炮台还能对从背后杀来的吴军将士形成一定威胁，然而当吴军将士杀到近处，开始以弹道可控掷弹筒集中轰击炮台后，清军的炮台也一座接一座燃起了冲天大火，其中还有几座炮台上火药被吴军掷弹筒炮弹引燃殉爆，直接炸塌了炮台。
从陌底镇全速赶来的清军机动兵力已经赶到了茅津渡，可是看到战场上横七竖八的同伴尸体和吴军的强大火力，跑得气喘咻咻的清军机动队却说什么都不敢冲锋进攻，加入战场。而黄河对岸的吴军大队却是毫不客气，马上就以新编团练为先锋发起抢渡，摇橹划桨的冲过黄河赶来增援。
第一支吴军船队渡河期间，个别幸存的清军炮台还开了炮轰击河面封锁航道，然而他们的位置才刚暴露，南岸的吴军火炮马上就开火还击，以钟表法和三角定位法双重测定距离后的吴军火炮也打得极准，没用多少炮弹就干掉了残余的清军炮台。
与此同时，吴军的苦味酸炮弹还对茅津渡的地面上展开了一次火力覆盖，尽管吴军的炮弹穿透力不佳，没能入地多深，可是苦味酸火焰还是引燃了不少的清军地雷导火线，提前引爆了清军用来阴吴军的黑火药地雷，保证了登陆部队的脚下安全。
“其实正面打也有把握突破，不过肯定没这么顺利，也更没机会大量歼灭敌人。”这是张之洞在南岸观战时发出的嘀咕。
事实也的确如此，在伤亡很小的情况下迅速渡过黄河后，吴军团练马上就开始了搭建浮桥，让后续军队