，电邀何应钦赴粤并引其晋见孙中山。何应钦被孙中山任命为大本营军事参议，协助筹办建校事宜。5月被任命为黄埔军校少将总教官，10月代理教授部主任，11月改任军校教导团（稍后为教导第1团）团长。 1925年5月，陈炯明叛军分三路进攻广州。何应钦率教导第1团追随蒋介石东征。2月，率部激战两日，歼灭淡水城叛军1个旅，继而稳定教导第2团，共同击溃增援之敌。3月，叛军集中主力寻求决战，与黄埔军在棉湖展开激战。何应钦率第1团为主力，由蒋介石督战。作战极为惨烈，何应钦甚至两次亲自率部反击和冲锋，终于以少胜多，击溃叛军。蒋介石由此对何应钦特别倚重。1925年4月，第一次东征有功的何应钦升任党军第1旅旅长。 1925年5月，何应钦率部参加平定杨希闵、刘震寰叛乱。6月，因党军扩充而升任第1师师长。8月，建国军和党军改组为国民革命军，仍任第1师师长。9月，率部追随蒋介石第二次东征。战至11月，攻克惠州，收复潮汕，全歼陈炯明残部。1926年1月，当选候补中央执行委员，升任国民革命军（总监为蒋介石）第1军军长。4月，兼任中央军事政治学校（3月由黄埔军校改组而成）教育长，积极支持蒋介石发动“中山舰事件”。 1926年7月，国民政府誓师北伐，蒋介石为国民革命军总司令。何应钦任潮梅警备司令，率2个师防守潮梅，1个师驻防广州。此时，福建督办周荫人企图乘虚而入，攻取广州。何应钦先发制人，于10月发起松口战役，大败局部，被任命为国民革命军东路军总指挥。12月乘势进占福州。1927年1月，何应钦任福建临时政治会议代主席和东路军总指挥。战至3月，克复杭州、溧阳、常州、苏州、上海、南京等地。5月，蒋介石兵分三路渡江北伐。何应钦任第一路军总指挥，先后攻占扬州和徐州。随后奉命率部撤回江南。7月，任军事委员会委员和常务委员。8月13日，蒋介石宣布下野，何应钦与李宗仁、白崇禧共掌军政大权。军阀孙传芳趁机集中主力反攻防务空虚的南京。何应钦与李、白指挥第1军和第7军等部在龙潭、乌龙山、栖霞山一带反复展开激烈的争夺战，战至31日而告胜利，歼敌5万之众，史称“龙潭之役”。何应钦因此而获得“捍卫党国”奖旗。10月，何应钦将所部改编为3个军，自己专任第一路军总指挥，连克蚌埠和徐州。1928年1月，蒋介石复任国民革命军总司令。2月，蒋介石将第一路军改编为第1集团军并兼总司令，何应钦改任国民革命军参谋长。6月，蒋介石宣布北伐完成。 1928年10月，何应钦兼任浙江省主席、国民政府委员、训练总监部总监。次年1月，蒋冯阎李召开军队编遣会议，何应钦出任编遣委员会常委兼中央编遣区主任。蒋介石的编遣方案激化了新军阀之间的矛盾。3月，蒋桂战争爆发，何应钦任“讨逆军”总参谋长、国民党中央执行委员，助蒋击败桂系。5月，任武汉行营主任。11月，张发奎与桂系联合反蒋，何应钦改任广州行营主任，主持讨伐。12月，粤桂战事告终，唐生智和石友山又起兵反蒋，何应钦遂前往武汉主持讨唐，迫使唐生智通电下野。1930年3月，何应钦出任军政部长兼武汉行营主任。5月，中原大战爆发，蒋军受到南北夹击。何应钦先以空城计赢得调整时间，再以衡州战役大败桂军，然后移师津浦线助蒋对阎冯作战。10月，改兼郑州行营主任。 1931年2月，何应钦兼任南昌行营主任和“围剿军”总司令。4月，向中央苏区实施第二次“围剿”，以损兵折将告终。7月，蒋介石为总司令，何应钦为前敌总指挥，发动第三次“围剿”，再次失败。1933年2月，何应钦为赣粤闽边区“剿共”总司令，指挥第四次“围剿”，仍未能逃脱失败的命运。 1933年3月，何应钦代理军事委员会北平分会委员长，主持华北