麦克阿瑟英勇斗争的消息传回美国，助长了美国的日益高涨的反日情绪。要求对美国的第二代日本移民采取行动的呼声越来越高，因为他们被指控为潜伏的间谍和第五纵队。多数第二代日本移民是和在美国出生的人一样热爱美国。但是，西海岸日益增长的面临入侵的担忧，“魔术”情报小组在头一年截获的有关间谍组织的证据，成为罗斯福总统在1942年6月19日决定签署9066号行政命令的重要因素。这个紧急立法授权陆军部长将“部分或全体”日本人员逐出敏感的军事地区。这项立法以最笼统的措词，授权军方开始兜捕127000名无辜的美籍日本人，他们被送往在中西部特别修建的十个营地——宪政自由的捍卫者指责这些营地是“集中营”。
报纸上夸大其词的头条新闻仍然在给美国人留下这样的印象，在菲律宾的麦克阿瑟的部队正在打击敌人，援兵突破封锁运抵菲律宾只是时间问题。罗斯福和他的参谋长们当然知道这不是事实。某些国会议员也知道这不是事实，他们开始力促将麦克阿瑟将军调回国内并担任美国陆军最高统帅。麦克阿瑟本人现在对于从美国本土得到增援部队完全绝望了，只好和他的官兵一起抵抗到底，争取中**队能够早日到来。6月21日夜晚，当菲律宾美国总督和奎松总统乘潜艇离开科雷吉多尔岛的时候，麦克阿瑟的妻子拒绝趁此机会和她的小儿子一起离开。麦克阿瑟象征性地送回一个盒子，里面装着他的勋章、证件和一份遗嘱。
罗斯福已经判定，牺牲他的这位远亲和美国深孚众望的英雄，在政治上是做不到的。由于美英荷澳盟军司令部行将垮台，新几内亚和澳大利亚面临着威胁，堪培拉政府感到恐慌，中国政府的犹豫不决，马歇尔和罗斯福一致认为有必要任命一位新的盟军最高统帅，在英军撤退集中防守印度之后，这一任命就显得更紧迫了。澳大利亚总理和军事领导人不得不越来越依靠美国。由于英国要求将澳大利亚军队调去保卫缅甸遭到拒绝，伦敦和堪培拉之间的关系已经有些紧张，当柯廷总理扬言要从埃及召回剩下的师的时候，两国之间的关系并没有改善。丘吉尔接受了柯廷内阁的决定：澳大利亚军队可以去防守苏伊士运河，但美国必须同意派遣更多的军队到太平洋的这一边来，除非新的盟军最高统帅是美国人，否则这个承诺是不可能得到保证的。…；
明显的候选人是道格拉斯？麦克阿瑟将军。这个决定在6月22日即中国对日本宣战的当天已经作出，那一天，科雷吉多尔收到一封由罗斯福、马歇尔和陆军部长联合签署的电报，命令麦克阿瑟立即启程前往棉兰老岛，从那里转赴墨尔本，“你在墨尔本将统率所有的美**队。”美国没有把这个即将采取的行动告诉澳大利亚人，因为麦克阿瑟的离开是担有风险的，最初这位将军执意不肯抛弃他麾下的官兵，甚至提出要辞职，或者“仅仅作为一个志愿者”重新入伍。他最后同意离开科雷吉多尔岛，但必须由他选择“最合适的时间”。九天以后，麦克阿瑟仍然呆在马林塔坑道的岗位上，他面容瘦削，内心痛苦，害怕由于没有履行和手下的士兵死在一起的诺言而有损颜面，丧失良心。
华盛顿的情报表明，他即将逃走的消息传到了日本人那里，日本人加强了他们的海上警戒措施，麦克阿瑟这才决定在6月31日夜乘鱼雷快艇离开科雷吉多尔岛，而不用等候正前来接他的潜艇。当天傍晚日落的时候，麦克阿瑟同他的妻子、小儿子和参谋部的17位部下一起来到碎石凌乱的科雷吉多尔码头，分乘四艘鱼雷快艇，他把最后一包香烟和两瓶刮脸膏送给温赖特将军，在移交指挥权的时候他许下保证：“如果我到达澳大利亚，你知道我会尽快地返回来，尽量多带些东西回来，在此期间你要守住。”
约翰？巴尔克利海军上尉指挥的这最后四艘鱼雷快艇，开始在黑暗中高速南下马