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自此，董卓便有恃无恐，为所欲为。首先他迫使朝廷免除司空刘弘的职务，自己取而代之。接着，董卓废掉少帝，将他贬为弘农王；另立陈留王刘协，即为汉献帝。时任尚书的卢植曾当面提出反对意见。董卓立即命令士兵将他推出斩首。幸亏侍中蔡邕极力劝阻，卢植才免于一死。
废立皇帝之后，董卓又对何太后看不顺眼，认为她妨碍自己在朝廷的自由行动。于是，董卓又大会群臣，数落太后所谓的罪行，说她曾经逼迫婆母永乐皇太后，致其忧虑而死。这种不讲节孝的做法，应当受到严处。之后，董卓便责令何太后迁居永安宫。不久，董卓又借故杀死少帝刘辩，并毒死了何太后。
通过对中央政权最高阶层的更换和打压，整个东汉朝廷几乎完全受制于董卓。皇帝的废立、朝臣的任免、重大政策的制定，都由董卓说了算。
改立献帝之后，董卓将自己升迁为太尉，成为三公之一，掌管全**事和前将军事务。后来又自封郡侯，拜国相，跃居三公之首，掌宰相权。董卓虽然名为“一人之下，万人之上”的国相，但实际上却远远超越皇帝，享有“赞拜不名、入朝不趋、剑履上殿”等特权。
一人得道，鸡犬升天。自己加官进爵后，董卓还利用自己手中的特权，大肆加封董氏家族成员。他首先封自己的母亲为池阳君，越礼配备家令和家臣，地位与皇家公主相当。同时，董卓又拜弟弟董曼为左将军，封雩侯，另外还封自己年幼的孙女为谓阳君。更有甚者，“卓侍妾怀抱中子，皆封侯，弄以金紫”。此时，野心极度膨胀的董卓，已经目空一切。
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初到洛阳时，董卓手下虽然也集结了一批心腹亲信，但是，要在庞大的中央官僚体系中纵横捭阖，单靠这些人是远远不够的。况且当时朝中许多有一定势力和影响的官僚，根本就不服董卓。对此，董卓在玩弄权术的过程中，暗中培养爪牙，广泛收罗亲信，用拉拢、****、排挤等手段打击和陷害一切于己不利的势力和集团。封郡侯后，董卓极力拉拢司徒黄琬，司空杨彪。三人在朝中拉帮结派，沆瀣一气，抬举和扶植已被贬斥的陈蕃、窦武等人。董卓不光全部恢复陈蕃等人以前的爵位，还擢升他们的子孙，以使他们世世代代为己所用。
董卓利用手中特权，重新提升和任用大批党人，如吏部尚书周铋、侍中伍琼、尚书郑公业、长史何颥、司空伍处士等。不仅如此，只要是与以上人员有关的党锢之徒，董卓都把他们拔为列卿，一时之间，“幽滞之士，多所显拔”。当朝家蔡邕也曾被董卓拉拢和征召。蔡邕不想再涉足政治，婉言拒绝。董卓便威胁蔡邕：“如不听命，我将诛杀你们全族。”蔡邕恐惧，只好回到洛阳。董卓大喜，任命他为祭酒，十分敬重蔡邕，三天之内，历遍“三台”，官至宫廷随从官。
董卓除了在中央各部布置亲己势力外，还通过任命太守、刺史等手段安插地方爪牙。这样，董卓通过层层安置耳目，基本上已经控制了中央和地方的主要政治力量，只要是不满他的官员稍有动作，他便毫不留情地予以彻底铲除，杀鸡骇猴，威慑朝野。
卫尉张温曾担任太尉，素来对董卓飞扬跋扈、野蛮残忍的行为极为不满。董卓也视张温为眼中钉，为了除掉这一心头大患，董卓便在朝中散布谣言，诬蔑张温与袁术长期勾结，对抗朝廷。不久，便以“莫须有”的罪名，笞杀张温。在董卓的淫威逼迫和阴谋陷害下，他的竞争对手和朝中许多忠义之臣，不是被逼迫出逃，就是被铲除消灭。
贪欲驱使下的董卓，野心几度膨胀。为了满足自己的野心，他恣意玩弄权术，滥杀无辜，引起广大官员和百姓的强烈愤慨和反对。
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董卓率军初进洛阳时，见城中富足贵族府第连绵，家家殷实，金帛