在边境抵抗华军强大装甲攻势的只有隶属于苏联内务人民委员部的各边防总队和少量野战军。这些边防部队配备了大量的冲锋枪和机枪。内务人民委员部的士兵都是极为顽强的，他们凭借坚固的工事。不仅以疾风骤雨般猛烈的射击给进攻的华军造成了重大的杀伤，而且往往打到最后一个人。象苏军第90边防总队第13号哨所从战争第一天一直打到4月12日，坚持战斗达11天之久。在战斗的最后一天，该哨所残余人员在被华军战斗工兵用炸药爆破的前一刻，还在已化为废墟的哨所内拼死抵抗。而在第10集团军步兵第8师防御地区，工兵第57营在师主力赶到前阻止华军的攻势直到中午12时。但这些兵力薄弱的部队并不能挡住华军的去路。华军将他们交给后续的步兵部队去解决，装甲纵队则绕开其坚守的哨所和工事，向苏联领土纵深快速推进。在中国坦克开进的方向上，那些本来应在边境工事中抗击华军的苏联步兵师，此时还在离国境8至20公里的地方。他们大多无法接到上级命令。因为在被中国人收买的当地民族主义者的破坏下，苏军在许多地段的有线通信系统几乎瘫痪。在西伯利亚特别军区，通信在中国人越过国境的4时30分便被破坏；而在秋明特别军区，由于无线电断断续续，直到上午9时军区才对形势有了一个粗略的了解。在这危急关头。面临华军强大突击的苏联指挥官们只能冒险打开战前发给的装着国境防御计划的保密密封袋（在苏联体制下这是很危险的），按上面规定的地点和路线（除此之外他们几乎对周边的敌我态势一无所知）。在只有少量弹药的情况下（苏军的弹药库是由内务人民委员会管理的，在当时的紧急情况下，各部队往往来不及从那里领取到弹药），将属下那些对突然降临的战争感到茫然的部队匆匆忙忙的带出兵营，在华军不断的空袭和炮击下，冒着巨大的伤亡集结开进。在这一过程中，士兵们已被不断呼啸而至的中国飞机，和不知来自何方的猛烈炮火（华军侦察机不断矫正着炮兵的射击）打得精神沮丧，当他们在行进间突然遇上由大量摩托车，越野卡车，半履带装甲车伴随的华军坦克契形纵队时，根本无法进行有效的抵抗，有些部队甚至因此而溃散。红军第4集团军第一号战报这样描绘当时的情景：在战斗中，“往往要由从集团军司令员起的各兵团指挥官来制止凌乱后撤的分队。有时是整支部队。让他们掉头再上前线，但是这些措施，有时甚至是使用武器，并不能获得应有的效果”。对于苏联边境所发生的事态，新任的中国陆军总参谋长蒋百里上将在当天日记中的记述倒显得更为冷静，客观：“敌人（苏军）被我军的进攻打的措手不及，他们的部队没有做出防御战斗部署，边境地区的部队在各自的防区分得很散，国境线本身绝大部分地段的警戒是薄弱的。”…；
在中国飞机刚刚攻入苏联不久，遭到攻击的东部各军区便向莫斯科的国防人民委员部发出报告。当总参谋长朱可夫按国防人民委员铁木辛哥的命令。将这些关于华军对西西伯利亚各城市和地区进行空袭的消息用电话报知斯大林后，这位苏联“当家的”陷入巨大的震惊，以至久久不能做出回答。当他回过神后，便用嘶哑的声音让朱可夫、铁木辛哥和全体政治局委员来他的办公室（也有史料认为这些人很早就集中在了斯大林办公室）。4时30分。当人都到齐之后，看上去非常茫然的斯大林打破了沉默。
“你们有什么建议？”斯大林向军事统帅们问道。
“指示边防军全线出击，遏制住敌人的进攻。”朱可夫马上表态道。
“不是遏制，而是消灭敌人。”铁木辛哥元帅则赶紧进一步表态。
由于斯大林同志发话了，铁木辛哥，朱可夫和政治局委员们马上变得相当乐观起来。正是在这种乐观的气氛下，铁木辛哥于7时15分以总军事委员会的名义发出了第2号