政府的废墟上兴平时，如果国家处于战争状态，那笼络人心的最好机会是提出和平的前景，因为和平总是民众向往的目标。所以，尽管拿破仑内心希望用战争解决一切，但他表现出来的却是一副渴望和平的面孔，他一上台，就急于照会各国他已进入执班府，并向英、奥、俄三国君主建议尽快停止军事行动。1799年的圣诞节，他向英王乔治三世和奥皇弗兰西斯二世发出私人函件，暗示以现状之基础来和平解决一切重要问题的时机已经成熟，他还暗示奥军应照原有和约撤回到阿迪杰河一线。英国国王没有理睬拿破仑的去信，只让大臣回复了一封傲气十足的函件。这位大臣在这份函件中说：“如果法国真诚渴望和平，那么，现实的和持久的和平的最好和最自然的保障就是让法国原来的王室复位。这个王室统治法国已达数百年之久，并使法国国内安享太平，在国外备受尊敬。无论何时王室统治的恢复将立即排除和平谈判的一切障碍。〃同时，英国首相威廉。皮特在下院猛烈攻击拿破仑，他用古罗马西塞罗的话坚决拒绝和谈建议：”为什么我再一次拒绝媾和呢？因为这种和平是不可靠的、危险的，因为这种和平是不可能缔结的。〃得到英国的答复后，拿破仑高兴地搓着手对他的外交部长塔列兰说：“这是再好不过的了，这一回答充分地满足了我。英国需要战争，英国将会得到它。是的，是的，殊死的战争！”1800年1月7日，拿破仑向军队宣布道：“军人们，对于你们，我不仅要求你们保卫疆土，我们还必须侵入敌国。〃同一天，他任命弟弟吕西安为内政部长，这样他就可以控制警察、国内治安和新闻检查。次日，他下令成立一支执政警卫军，共2100人，包括两个榴弹步兵营、一个步兵连、两个骑兵连和一个炮兵连。这支队伍以后就发展成皇帝的禁卫军。
奥地利也拒绝了拿破仑的和谈建议，因为这时的奥地利军事上正处于优势，奥地利又一次成为意大利的主人并企图从意大利发动对法国的进攻。1800年4月，梅拉斯的奥军把萨沃纳附近的法军截为两段，絮歇的部队被迫向尼斯撤退，被赶回到瓦尔河畔；另一支马塞纳的部队也被围困在热那亚要塞内。尽管马塞纳和副手乌迪诺、苏尔特奋勇作战，但终究抵挡不住两倍于他们的敌军进攻，处境十分困难。奥军司令部计划是尽快迫使马塞纳投降，以便大军西指，攻入尼斯、普罗旺斯、甚至萨瓦，围歼絮歇部队，唤起南方保王党的叛乱，造成法国的瘫痪。奥军司令部的计划是有条件实现的，但是，其作战计划却有一个很大的漏洞，那就是梅拉斯将奥军庞大的兵力置于敌人可以从后方（即瑞士）打击的地方。这一漏洞没有逃过拿破仑的鹰眼，他决定采取一项全新的而且极为大胆的作战计划。
拿破仑命莫罗指挥的莱茵战线的10万大军在巴伐利亚一带活动，同克顿率领的奥军作战，以吸引住奥军的力量。他自己则采取一个冒险的行动，他不去顺应敌人的设想，去援救在热那亚陷入困境的马塞纳部队，而是从瑞士经过大圣伯纳德山口进入意大利，从后方袭击梅拉斯军队，夺取他的各个仓库、辎重库和医院，截断梅拉斯和奥地利的联系，迫使梅拉斯在被动的状况下作战。而梅拉斯奥军的失败就能使意大利的整个奥军覆灭，使法军重新赢得意大利。执行这个计划要求行动迅速、极端秘密和非凡的勇敢。但是，保守秘密是非常困难的，到处有英国和奥地利的间谍。必须瞒住他们，或者把他们引入歧途，为此，拿破仑决定制造假情报。
1月25日，拿破仑对他的陆军部长贝尔蒂埃下了一道手谕：“我的意图是要组成一个预备军团，由第