在那天斩首一万余级，抓到了两万多名俘虏。扣掉成功逃回大阪的几千人之外，还有两万幕府军下落不明，估计都在半路上不知跑到哪里去了……而一代目家康给德川氏留下的家臣团也损失过半。
如此伤筋动骨的丢脸惨败，在德川家的历史上似乎还从未有过，被世人比作战国武田家的长莜合战。当时已经退隐的二代将军“大御所”德川秀忠，在闻讯之后当场吐血三升，被活活气死。
自此，日本结束了自平安时代以来天皇听上皇、关白听太阁、幕府将军听大御所，这种老人垂帘听政的二元政治传统。德川家光将军在惶恐和迷茫之中，顶着“败家子”和“昏君”的骂名，开始了大权独揽的统治生涯——然而此时德川家的局势实在恶劣，作为核心的嫡系武装力量几乎损失殆尽，威望和震慑力也出现了雪崩式暴跌，而大获全胜的毛利军却是趾高气扬、斗志高涨，“打到关东，火烧江户”的呼声一时间甚嚣尘上：按照当时幕府重臣们的悲观推算，如果长州军大举来袭的话，西国各藩恐怕都会叛离幕府，德川家只能放弃无险可守的京都，专心在大阪笼城坚守，为幕府在关东后方重组军队尽量争取时间了。
幸好，当时的战局总算是没有发展到如此悲哀的程度——毛利家方面似乎很清楚自己实力有限，并没有将战争长期化的打算，而是表现出了成熟政治家的风度，在得胜之后就释放了全部的幕府军俘虏，同时乘胜提出一份有理、有据、有节的议和条款……在当时那种幕府军遭遇毁灭性惨败、天下各藩都在蠢蠢欲动的大背景下，为了防止长州藩反悔，德川幕府几乎急不可待地签订了停战条约，让日本再次恢复了和平。
待到战火稍息，局面初步恢复平静，大败而归的德川家光将军痛定思痛，决心无论如何也要加强军事建设，而这也是整个幕府上下的一致共识——德川幕府号称有“八万旗本”，但实际上全部的旗本武士和御家人加起来还不足一万，得要把农兵足轻也算上去，大概才能凑出八万人左右。这回在长州藩一口气损失了几万农兵和几千武士，当真是连脊梁骨都被打断了。再不重整军备的话，难道要等着倒幕风潮兴起吗？
但虽然已经统一了决心，可如何筹款却还是一个大难题——自古以来，打仗就是烧钱，此次动员数万之众的征长之战，本来就已经把幕府的库存给打空了。接下来，为了跟长州藩停战议和，德川家又不得不割让了关西的好几处幕府天领，连之前好不容易从毛利家抢来的石见国生野银山，这回也被毛利家重新收了回去，其余各藩对待将军的态度也大不如前，使得幕府的财政收入连年下跌。
到了去年（1630年），幕府的另一个重要财源，佐渡岛上的金山又遭遇海盗袭击，开采出来的黄金连同几乎所有矿奴、监工全都消失得无影无踪，根据几个神智错乱的幸存者声称，是几艘不可思议的大铁船和一群奇装异服的厉鬼洗劫了佐渡岛……这样的疯言疯语自然没人会信，但幕府财政再遭重创却是不争的事实。总之，德川幕府在战后足足喘息了两年之久，才想尽办法凑出了重整军备的经费。
但是，仅仅有了钱还是不够的，德川家还需要更有威力的军火和近代化的作战模式。
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通过“征长战争”惨败的亲身体会，德川家光将军已经充分地认识到，德川幕府的传统封建军队与毛利家的新式长州军之间，究竟存在着怎样让人绝望的战斗力差异——除了少数职业的旗本武士之外，幕府军的大部分士兵都是在临战前仓促编组起来的足轻。偏偏在征长战争爆发之前，日本已经有整