后，立即命令基地人员将一万多枚“质子水雷”，布置在逆天神可能袭来的外围海域中，而基地内部的所有“深海震波鱼雷”也都做好了随时发射的准备。
这些深海攻击防御武器所使用的技术，全部来自逆天神那里，其破坏力都是地球物质无法承受的，所以宫本侍郎很有信心能攻破海岛基地的防御力量。
不过他也做好了失败的准备，将基地所有重要的科研人员全部转移到其中一艘科研潜艇里，准备随时脱离大和主体，逃往创世基地。
令他意想不到的是，体积庞大的海岛基地并不是从水下攻击来的，而是像舰船一般从海面漂浮而至。此时他已来不及改变质子水雷的布置方向，只能将深海震波鱼雷全部发射出去，意图先声夺人，在附近海域造成一个毁灭性的高频震波死亡区。
此时雷鸣禅和御翔天都面临着极其危险的境地，因为他们为了抓到宫本侍郎，不可能一上来就毁灭大和基地，而要瘫痪大和基地的功能运作，就得极其接近对方才可以。
他们想不到宫本侍郎会在开始阶段，就将所有深海震波鱼雷都发射出来。
海岛基地虽然能够防御住几枚甚至几十枚震波鱼雷的同时攻击，但是当它面对几百枚震波鱼雷同时爆炸，而产生的高频共震波的时侯，也超出了防御极限，立时粉碎了海岛主体，只剩下了总控制室在内的核心战斗体。
然而受到毁灭的并不只是海岛基地的主体，由于高频共震波的破坏力太过强大，致使布置在外围的一万枚质子水雷也被同时引爆，于是这股想像的巨大冲击波，将附近五十海涅内的所有生物都震成粉末，其中也包括来到附近的五艘各国核潜艇，和不断接近的所有航母舰艇。
而且大和基地也没能躲开冲击的影响，虽然它及时张开了用来防御震波鱼雷的“减震波防御罩”，但是质子水雷的爆炸冲击力却轻易将其破坏粉碎。于是除了用于逃生的科研潜艇没有毁坏外，其余的部分都变成了金属碎片。
这场出人意外的战争灾难，大大出乎了宫本侍郎的想像，虽然他见识过个体外星武器的威力，却想不到许多这种武器的同时使用，其威力却远远超过了单一威力的相加总和。
爆炸产生的巨大冲击力量，瞬间在日本南太平洋海域形成一道超过万米的庞大海浪，其威力之巨大，竟然连“死神之眼”台风中心的云层，也被冲天而起的能量漩涡搅得混乱不堪，于是这场有史以来最大级别的台风就这样草名其妙的结束了。
然而就在日本西海岸的人们，对突然结束的台风感到惊奇万分的时侯，他们又立即看到了可以称为人类历史上强度最恐怖的滔天海啸。
这时侯，无论世界如何的震惊，也改变不了灾难后人们的痛苦，这场史无前例的人为海难，其规模已经不能称其为大海啸，只能用排山倒海来形容。
事后根据美国地质专家考证，这场巨浪的威力相当于一颗直径五百米的陨石，砸在日本南太平洋海域里所释放的冲击能量，而更令人恐怖的是，这场灾难里还因为五艘核动力潜艇的毁灭，而造成了难以预计的海洋核污染。
在巨浪蓦然迭起的时刻，大和基地所剩的唯一一艘科研潜艇，与海岛基地一起被抛到了几百米的高空。
不过海岛基地在被冲击掉外围构造后，反而变得灵活起来，其巨大的变异核动力能量，在雷鸣禅的精确控制下，立刻起到了火箭喷射器的作用，将直径超过五百米的核心战斗体，变成了一个能够旋转盘旋的飞行器。
御翔天则震惊于这场人为灾难的巨大，他愤怒地发动了战斗体还留有的“热融质子炮”，也不顾先前的计划安排，悍然向仍在空中翻腾的科研潜艇扫射而去。
不过因为海浪冲击，以及颠簸不稳的诸多影响，他的愤怒攻击只是将潜艇的尾部