由于拿破仑的匆忙和大意，不仅登陆计划而且整个埃及战役计划从一开始就陷入了混乱。登陆行动突兀而不负责任，远征军的每一个战士都深受其害。实际上，拿破仑对于埃及的主要城市所在位置并不熟悉。在一年中最炎热的季节，他对其征途上的食物储藏、钱财、水井和储水地点却也一无所知。别说在异域作战，这样草率的作战计划就是在欧洲战场也是行不通的。何况这里是一望无际的荒漠，与富饶的欧洲有天壤之别。在运输方面也缺乏足够的准备，远征军只带来了数百匹战马，必须在本地寻找马匹、驴子和牛（后来还有骆驼）以供骑兵、炮兵和运输之用。但不仅在亚历山大及其附近没有这些可供运输的牲口存在，而且使他万分懊恼的是，他完全不知道哪里可以找到这些牲口。结果，直到数周后到达开罗以及其后数月，拿破仑的骑兵仍然没有坐骑，从而毫无骑兵的作用可言；他的车辆、弹药车、辎重、军官、工程师和行李车都缺乏动力和坐骑。
由于事前缺乏情报，几乎导致全军崩溃。拿破仑没有确定哪些地方是谷产丰富的地区（他们曾经到过罗塞塔和达米亚塔，但恶劣的天气使他们无法在那里登陆）；他也没有考虑何处有磨坊可以为他的军队磨制成吨的面粉，还有烤面包的烤炉——别看这只是一个烤面包的问题，这个问题差点使拿破仑的整个远征计划功亏一篑。
正常情况下，在政府授权军事行动之前数个月，贝尔蒂埃就应该收集这些基本的情报。但是，这次海军和陆军方面都没有派出情报人员到埃及了解有关后勤支援的情况。考虑到这次入侵的独特性，整个失败的责任完全应该由拿破仑一个人承担。事实上，他所得到的惟一的“情报”来源是夏尔·马嘉隆和普西格；他没有要求，也没有派遣或收到任何一个军事情报官员提供的情报。
就这样，孤立无援的拿破仑军队在茫茫沙漠上，既没有面包也没有水；成千上万的士兵死于干渴、饥饿、疟疾、中暑和疲劳。
第七章 法老的领地（4）
远征军司令的另一个疏忽是手上没有最新版的埃及地图。在这个几乎没有道路可供车辆行驶的国家，拿破仑实际上对于军队的行军路途和沿途情况一无所知，覆盖整个尼罗河三角洲的复杂的运河系统令他特别头疼。这个国家的桥梁奇缺，令人吃惊；这些运河，无论是干枯的还是有水的，都成了几乎是不可逾越的障碍。拿破仑的队伍无论走到哪里都必须不断跨越运河，其中有的大运河有120英尺宽。在埃及期间，他的军需运输车辆、炮车、弹药车以及步兵都不得不在极其困难的道路条件下艰难行进。
由于使用的是过时的老地图，对于沙丘问题也不能很好地处理。一旦在行军路途中遇到沙丘，只有翻越过去，这从登陆一直到开罗近郊都给军队的人员和物品运输造成了巨大的灾难。
到目前为止，还没有发现有埃及的部落和贝都因人①反抗拿破仑的事情发生。拿破仑相信自己的宣传，即：他是###和埃及阿拉伯农夫的朋友，马穆鲁克统治下的土耳其政府是他们共同的敌人。原本估计最多会遇到8；000～10；000名武装的马穆鲁克的抵抗，打上一两仗的拿破仑，实际上从亚历山大到开罗的途中一直遇到凶狠的武装抵抗，直到名义上攻占了这个地区之后仍然如此。
如果换成另外一个人，而且这种情况是发生在距离巴黎较近的地方的话，如此不称职的司令官很可能不仅被革职，而且早就送到军事法庭受审或枪毙了。可是，拿破仑没有为此受到巴黎政府的传唤（那里的政府对埃及作战的情况基本上是被蒙在鼓里），正如纳尔逊说的那样：“魔鬼的孩子自有魔鬼的好运！”
同时，克莱贝尔将军尽管脑部严重受伤，仍然可以指挥，至少每天可以离开昏暗的病房工作数小时（因脑震荡和颅骨挫伤，他还需要几