在拿破仑的支持下，共和国三巨头决定逮捕五百人院和元老院中的保王派议员。他们任命奥热罗为军事司令官，以保证计划的成功。这一行动正中拿破仑下怀。
果月17日午夜（1797年9月4日），奥热罗下令所有部队开赴指定地点，并在各桥梁和主要街道设置了大炮。拂晓时，两院大厅被包围，大批保王党人遭到逮捕，皮什格鲁将军和巴泰勒米督政官也被投进了监狱，只有卡尔诺督政官逃走了。就这样，果月18日政变没有遇到任何抵抗便完成了。
督政府胜利了，共和国得救了，节节胜利的拿破仑将军从遥远的意大利军营向督政府表示热烈的祝贺。
然而，督政府并未因此感激拿破仑，他们始终认为拿破仑是一头蜷缩着的、瘦弱的海兽，在潮水涌来时，会突然伸展出令人眩目的触须，置人于死地。他们起了一个让奥热罗来对付拿破仑的念头。
政变后的奥热罗将军被任命为莱茵方面几万大军的指挥，这位虚荣心极强的将军以为自己的地位可与拿破仑匹敌，开始趾高气扬起来。他站在督政府一边，发表了有指责拿破仑内容的声明。拿破仑愤怒异常，9月25日，他向督政府提出了辞职书：“我请求你们委派别人来替代我，批准我的辞职。政府这种可怕的忘恩负义的行为，完全出于我的意外。从此世界上再没有任何权力能使我为它服务了。我的相当地受到损害的健康情况迫切需要休息和安宁。我的精神状况也要求我在普通公民的行列中经受锻炼。在相当一段时间里，我被赋予很大权力，我在各种情况下都在为祖国的幸福服务。让那些不信奉善行并怀疑我的行为的人去说吧。我的安慰在于问心无愧和后世对我的评论。”
辞职是拿破仑的杀手锏，他知道自己对督政府的重要性。果然，尽管督政府很不喜欢这位势力不断壮大的年轻将领，但经过果月事变冲击后，他们已无力摆脱拿破仑了。他们要求拿破仑继续留在意大利军团总司令的岗位上。
坎波福米奥和约1797年夏天巴黎政局的动荡，使得奥地利和整个君主制的欧洲政府突然兴奋起来，他们盼望着督政府和共和国被推翻，波旁王朝复辟，从而得以收复所有被法国占领的土地。
但果月18日保王党的溃败使他们这些幻想破灭了。拿破仑看准时机，坚决要求督政府尽快地与奥地利签订正式和约。
9月27日，双方谈判开始。奥地利派了一个精明强干的外交家科本茨同拿破仑交手，可谓是棋逢对手，将遇良才。督政府由于挫败了保王党，过高地估计了自己的力量，坚持要把威尼斯和弗留利并入内阿尔卑斯共和国，坚持奥地利在意大利的损失只能在德意志寻找补偿。而科本茨伯爵则在头一次会议上就一口推翻了他的同事过去所允诺的一切，提出对意大利的新的要求。这是一场漫长而艰巨的谈判，双方互不退让，谈判出现了僵局。
这时，巴黎发来了最后通牒：若奥方拒绝法方提出的要求，则立即恢复军事行动，向维也纳进军。可拿破仑认为目前形势不宜重起战端，理由有三，一是奥地利只是暂时的和局部的被打败，它在总体上仍强于法国；二是英国正酝酿着第二次反法战争；三是法国国内形势动荡，战争连年，国库空虚，亟需一段喘息时间。因而，拿破仑拒绝执行督政府恢复军事行动的指令，他要想方设法促成两国和约的签订。
在这次谈判中，拿破仑表现出的外交才能丝毫不亚于他的军事才能。他把巴黎的最后通牒始终放在桌上，以提醒科本茨伯爵法国每一分钟都可能中断谈判，恢复进攻。科本茨伯爵对拿破仑的外交手腕起感头痛，他多次向本国政府抱怨说，很少碰到像拿破仑这样的诡辩家和毫无良心的人。
10月16日，谈判继续进行。科本茨再次强调：法国给皇帝的补偿还不及皇帝损失的四分之