督，令熊文灿前去敉平两广沿海的海匪，务使南方安定，不致生乱。
熊文灿到了广东，仍是祭起老法宝，用“招安”之法去诱那刘香老投降，派了游击、百户之类上了刘香老的舰船，谁料人家根本没有招安的打算，他派了官员上船，正是白送的肥鸭，除了侥幸逃走一个百户，其余上船的军官立时便被当场砍死，扔下船去。熊文灿闻报大惊，无奈之下便派人将郑芝龙召来广东平乱，这郑芝龙不愧是一方巨寇，听调带着数千手下，分乘数十艘战船，在广东沿海寻了刘老香十数日，终于在海上与那刘香老部相遇，两方于海上激战，仍是使用*帮登船肉搏的办法，一边是闽省积年的海盗，一边也是粤省纵横海上的豪杰，双方打的昏天黑地，一时间胜负难分。后来还是郑芝龙拼了老命，将上衣脱掉，口中含刀，一下子跃到那刘香老所在的船上，一刀捅死了这个粤省海盗头子，砍下脑袋示众，其部众这才丧失战意，全部被郑芝龙收伏。
此役过后，熊文灿向朝廷表奏封赏，郑芝龙因功晋为福建副总兵，实则整个福建的水师皆在其掌握之下，收伏了广东沿海数百股小盗后，其手下额兵数万，实力在整个南方屈指可数，又因收取来往船只的水引，加之日本南洋的贸易，不过是几年的功夫，已然是家资千万，可称的上是巨富豪强了。
张伟回到台湾已是一月有余，其间巡视全岛，阅兵、慰问伤亡军属、巡视各矿、工厂、台北台南的官学他亦亲自前去查看，与两官学的学子探讨交流一番。此时已有不少入学三年以上，年纪在十五以上的学子，张伟精心挑选三百名身体强健，学识品格皆优的学子，纳入了新成立的台湾讲武堂，张伟亲任讲武堂学正，在全台军中挑选战术战略皆有见地的军官以允教官，以期三年后这批学生毕业，可以迅速加入预期中一定要扩大规模的台北军队。
他又改台北炮厂为台湾兵器局，又令孙远化署理赞画，见他没有去意，一心用在改良张伟所有的枪支火炮，又潜心研发火炮战车，张伟心中甚是高兴，便向那孙远化提出发给其补助，谁料孙元化一口回绝，言道：“元化之所以如此卖力，实是希望能在台学有所成，在兵器制造上更进一步，将来好在辽东报效大明朝廷，指挥使的银子，元化愧不敢领云云。”，张伟这才知道此人是拿台湾的银子做免费的试验，他到也不恼，笑咪咪拍拍孙元化的肩，洒然而去。他已秘密派人去将孙元化的家人接来台北，眼看天下行将大乱，崇祯哪能顾的上他这个小小的兵部员外郎，便是他的恩师徐光启，此时虽已任了礼部侍郎，看起来皇帝甚是信任，不过除了倚仗徐光启多铸火炮外，对于其所有的建议条陈，一概否决，不久之后，这位徐大学士便会心灰意冷告老还乡，又还有谁能记得他这位学生？是以张伟绝不担心此人会带着一肚子的试验成果溜之大吉，反道对他要钱给钱，要物给物，除了期望火炮改良，还希望此人能在火枪上多加研究。若是能如清朝康熙年间的戴梓一般研究出最原始的机关枪，张伟可不会学康熙皇帝，将他充军宁古塔了事。
这一日听得那孙元化言道已解决了火炮升降的麻烦，又铸成了带膛线炮弹改为柱形的大炮，张伟便在台北卫指挥所衙门击鼓传召诸将，凡都尉以上皆会聚台北兵器局炮厂，一时间这淡水炮厂冠盖云齐，张伟令新制的各色腾龙军旗飘扬于炮厂内外。众将军皆上着大红圆钞帽，下着绵衣棉甲，腰佩规制相关的仿唐长刀，脚蹬黑布白底官靴，胸佩铁牌，上刻腾龙，下刻姓名官职，权以区别将官与士兵的服饰，其余士兵、伍长、果尉等在服饰上也各有区别，又依上次攻台南一役的表现制铁、铜、银、金、各腾龙纹章，以功劳赏给，以纹章受赏，其家亦减免赋税有差。自此以后，台北军制、军号、军令、军旗皆已完备，除了俸禄优厚，又有官职、服饰、纹章、功郧减赋等优厚军人振奋军心的举措，孙元化这