蔣介石壓恨兒就沒想到孫科會在選舉中失敗，因為&ldo;國民大會&rdo;是由&ldo;&rdo;派控制的，而且陳立夫曾向蔣介石保證孫科一定會當選。但是，目前的狀況卻使蔣介石大為吃驚：李宗仁這個平庸的廣西軍閥竟會在&ldo;國民大會&rdo;選舉中獲多數票。蔣介石曾答應孫科，副總統職位一定是他的，選舉只是走走過場而已。因此，李宗仁當選為副總統，使蔣介石感到自己在失面子。
最糟糕的是，李宗仁竟然故意不聽命於他，這在蔣介石看來是最不可寬恕的&ldo;罪行&rdo;。
這次&ldo;國民大會&rdo;在其他方面進行得也不太順利。在當選的代表中，有一些人在開會時被國民黨人員拒之門外，因為把他們的席位分給了國民黨提名人。
一些遭到拒絕的&ldo;國會&rdo;代表宣布絕食，其中一人帶著棺材住進了接待室。他威脅說，如果不給他席位，他就要去死。在對此進行商討時，南京大主教于斌說服&ldo;絕食者&rdo;喝定量的水、桔子汁和牛奶，以維持生命。最後，這些代表終於得到了他們的席位。為了接受並安排他們，會議不得不擴大範圍。
國民黨人因在選舉副總統時未占上風，感到極為不安，他們想通過提議選舉何應欽為總理來挽回其喪失的地位。但是，他們的勢力太弱了，以致無法取勝。後來，這個職位由幹練、廉潔的翁文灝擔任了。翁文灝的出現使新內閣具有某種更加自由的色彩，但現在要徹底改變其形象，已為時過晚了。
在所有這些挫折面前，蔣介石仍繼續給人一種高做、鎮定的形象。1948年5月20日，他在就任中華民國總統時說：
他不否認中國前面的道路困難重重，也不否認重建中國是件不易之事，他認為實行民主的基本條件尚未成熟，但時代的力量已使國民黨向前走上了立憲民主的道路……。
他還說：他這40年來領導國家取得的經驗，使他更加堅信孫中山先生的格言，任何措施&ldo;只要符合自然規律，只要符合人類認識水平，只要順應世界潮流，只要反映人民願望，並為社會精英所發現，就一定會成功地實現。&rdo;
蔣介石外表鎮靜，卻掩蓋不了內心的不安，並且在這個時候比任何時候表現得都明顯。
國民黨漸漸控制不住東北的據點了。他們於3月12日從吉林撤出，並用軍事上慣用的陳詞濫調解釋說這是為了縮短運輸線。駐軍撤到長春，給這個被圍城市增加了極大的負擔。共產黨封鎖了通往長春的所有食物供應路線，每天餓死的人高達100之多。經過激烈爭奪，四平在吉林失陷三天之後失守了，而共產黨此時可以向瀋陽發起進攻了。
美國軍事顧問小組的頭頭大衛&iddot;g&iddot;勃爾懇求蔣介石撤出瀋陽，結果是徒勞，蔣介石的自尊心不允許他接受大衛的建議。4月24日，共產黨的彭德懷將軍經過一場苦戰後，重新奪回了毛澤東原來的根據地延安。接著，國民黨也打了勝仗，但為時不長，這時情況已很明顯，中國人民解放軍已不再是游擊隊，而是正規軍了。6月份，在河南開封之戰中，陳毅將軍率領近20萬大軍與數量相等的國民黨軍隊展開了戰鬥，該城於22日失守，但25日又奪了回來。
在上海貨幣市場進行的調查表明，中國通貨膨脹的速度是驚人的，幾天之內，美元與法市的兌換率由1：200萬漲到1：
400萬。幾星期後，非官方兌換率達到1：800萬，法市又減值了一半。8月份，比率又上漲到1：1100萬，高得令人難以置信。當通貨膨脹開始加劇時，蔣總統卻在一篇講話中說，經濟形勢令人滿意，通貨膨脹全是共產黨宣傳的結果，是外