几乎每一个日本人都会参拜神社，特别是出生、结婚和死亡时，肯定都会和神社打交道，哪怕他本人是其他宗教的信徒，因而几乎每个人都被视作某一神社的“氏子”。…；
在这个意义上，掌握了神社神道，就等于掌握了全体国民。因此，战前，日本军国主义当局以神社神道为主体建立了旨在对国民进行思想统治的“国家神道”。二战结束以后，占领日本的盟军总部为了防止军国主义复活，于1945年12月向日本政府下达“神道指令”，废止国家神道，实行政教分离。
鉴此，大日本神祗会、皇典研究所等神社神道团体于1946年2月14日共同设立了非国营的宗教法人——神社本厅。它以奉天皇祖神天照大神为主神的伊势神宫为本宗，以“尊奉神祗恩德，谋求神社兴隆，宣扬神道，作兴道义”为宗旨，在全国各个都道府县都设有支部—神社厅。
至2000年2月末，它已经下统分布于全国各地的近80100家神社或团体，拥有神职人员27500人约占全国神社总数的98％。它的法人代表叫“统理”，决策机构是由神职人员和“氏子”（即信徒）中选出来的代表组成的“评议员会”，执行机构为理事会。
而教派神道则不同，它们是源自产生于江户时代后期的新宗教，明治政府先后布批准这些新宗教和其他教派等13个教派为“教派神道”，俗称“神道十三派”。这些教派的特点是，各个宗派几乎都有明确的教义和教规，以及严密的组织，名称上几乎都有一个“教”字，显示了它们具有一定的独立性。
二战结束以后，原十三派除了一些教派退出以外，余者组成了作为教团的教派神道联合会。1964年，教派神道联合会所属的分支教派已达80余个。至2000年12月末，教派神道共有信徒361万人，拥有教会等法人团体5860个。
教派神道的信徒数量虽然远不能与神社神道相比，但在日本社会仍然占有一定地位并具有相当大的影响力。
此外，还有一种流派叫做民俗神道，不过这种流派无严密组织，是农民自己祭祀农事和路神。祭拜的“神”差不多都是些山精树怪，也就相当于中国的yin祀，所以不入主流。
然后就是佛教。
对于日本来说，佛教虽然是外来宗教，但是现在已经彻底本地化了。它的历史却非常悠久，在日本封建社会的发展大体上经历了盛行传统佛教阶段（奈良时代和平安时代）和盛行新佛教的镰仓时代等两个阶段，到江户时代和明治维新以后进入了低潮期，二战以后又逐渐有所发展扩大。
目前日本佛教在全国共有约8万个寺院或布教所，神职人员20几万，分别属于各个宗派，其中有90％以上属于全日本佛教会及其下属的宗派、团体。全日本佛教会是日本佛教界惟一的联合体组织，下属团体达100余个。
共有佛教信徒接近一亿人，其中天台宗系统300多万人；真言宗系统1000多万人；净土宗系统约2000万人；禅宗系统300多万人；日莲宗系统接近2000万人；奈良佛教系统接近100万人；未加入全日本佛教会的所谓“单立宗教法人”中的佛教信徒（如创价学会等）接近4000万人。
然后就是基督教系统。基督教这个外来宗教在日本的发展历程可谓一波三折。它既受到过残酷的镇压，也受到过有力的扶持。日本国民对这个宗教似乎颇有亲近感，越来越多的青年人愿意在基督教的教堂举行婚礼就是一个明证。但是，正式接受洗礼加入基督教的信徒却不见增加。
日本基督教联合会的团体会员共有60个，其中最大的是天主教中央协议会。日本基督教协议会则主要是新教的全国性组织，拥有33个正式或准正式加入的团体会员，其中最大的是“日本基