时空的奥义是宇宙最基本、也最难触及的规则之一，发现自己的神格法则中蕴含着时空的奥义后，美杜莎多了一些逃脱雅典娜控制的信心。
即便是主神也不能直接窥探其他神祇的神格，雅典娜逼迫美杜莎展露自己的神魂，好让她研究候补主神的特点，美杜莎知道她想了解的是关于接替神位的神格法则，所以每次都很自觉的将那部分神格法则展露给雅典娜看，并且竭力隐藏着那些诠释了时空奥义的神格法则部分。
被幽闭在完全黑暗混沌空间里的她，默默的修炼着，等待着机会。
而这一次命运的天平终于向她稍微倾斜了一些，她有了足够多的时间。
数百年后，奥林匹斯神域与阿斯嘉德神域爆发了一场旷世神战，在战争中，雅典娜在战斗时曾多次利用自己神盾里封印着的美杜莎头颅，让她使用石化能力帮助自己战斗。
其实美杜莎已经有过几次逃脱的机会，但她一直忍耐压抑着，等待着最好的时机。
直到雅典娜在战场上重伤，因为庞大的战争使神域的信仰池中的信仰之力近乎枯竭，雅典娜不得不来到地球的神殿里直接接受众生的信仰之力治愈神体。
但怎知阿斯嘉德的女战神弗蕾亚也恰巧来到地球，两大女神感应到彼此的存在，在地球的海洋上大战起来。
雅典娜被称为智慧与战争的女神，其实她更为精通的是战略，而不是战斗，雅典娜的战力比起弗蕾亚差了一截，在太平洋上的战斗里，弗蕾亚击落了她手中的神剑与神盾。
美杜莎知道自己一直等待的机会终于来了！在神剑与神盾落入大海之后，她立即使用空间法术，携着智慧神剑与雅典娜神盾瞬移到远处。
趁着雅典娜无暇分身的时候，她倾尽全力脱离了神盾的封印，给自己的头颅施加了封印气息的法术，然后抽走了神剑与神盾的器灵，通过器灵开启神盾所连接的次元空间，躲进了次元空间中。
然而终于逃出了雅典娜的控制，但美杜莎心里却没有任何欣喜之意。
因为为了躲避雅典娜的搜索，她不得不把神盾与神剑的器灵也带入了次元空间，封锁次元空间与现实世界的链接，然后给自己的头颅施加了隔绝气息的封印法阵。
这就相当于她带着钥匙，进入了一个只能从外部打开的房间。
能让她重见天日的方法有两个，一个是她将时空奥义领悟到，能够不依靠神力也能施展时空法术，突破神器的内部空间回到地球世界。
另一个则是她在自己的头颅上留下的一个法阵，从她躲进次元空间里一百年后，预计雅典娜已经放弃在汪洋大海里寻找她的头颅，封印会开始变化，当她的头颅在外界受到强烈的刺激时，头颅中的神力会激荡起来，自行冲破封印，开启地球世界与神器空间的链接通道。
然而前者几乎是不可能的，就算是原始神也无法做到，后者则完全依托机遇了……
她所设定的强烈刺激包括遭受猛烈攻击、接触到有灵气之物、吸收到一定程度的生灵血气等等，虽然她知道自己的头颅多少会显露一些神体的神威，令对危险敏感的海洋生物不敢靠近，但也是没有办法的事。
于是美杜莎只能在无尽黑暗的空间里，默默的等待着，沉睡了又苏醒，苏醒了又沉睡。
她忘记了自己度过的时间有多久，只有孤独陪伴着她，在漫长的时光中，她将自己的神魂修炼到了非常强大的境界，洗净了神魂中的诅咒，如果只论魂力的话她已经能与主神媲美，或许再遇到雅典娜时，她也能有一战之力。
然而那又有什么意义呢？
当历经生命意义的丧失，近乎永劫的沉沦，美杜莎身处无尽黑暗混沌中的时候，内心只剩下一个渺小卑微的梦想，那就是重新看一眼世界罢了…