撤退工作从十日夜间开始，按照陈必时的部署，首先将民兵撤退到长江北岸。
陈必时这么做，不是为了照顾民兵。南京的民兵，几乎都是南京市民。从稳定军心士气来讲，首先将这些人撤走，才能确保北岸的防御部署不出现漏洞。要知道，这些民兵的亲属全在长江北岸。
作为战区司令，陈必时没有立即离开南京。
事实上，当时甚至有人认为，陈必时会留下来，不会随同部队一起撤退。
不管怎么说，陈必时在这个时候做了一名司令官应该做的事情，那就是留在后面，与将士同甘共苦。
只不过，这种英勇的表现，在其他人看来，却完全没有必要。
十一日，刘诚志就给陈必时打了电话，要他跟随第一批正规军撤到长江北岸。为了说服陈必时，刘诚志还提出了在长江北岸组织战略放弃的要求，而作为战区司令，自然应该把重点放在防御部署上。
问题是，这并没说服陈必时。
虽然在第二天，陈必时就让战区司令部撤到了长江北岸，但是他仍然留在南岸，亲自负责东南军在外围防线上的部署工作。
陈必时的这些举动，让外界产生了疑问，甚至在东南军内部也出现了类似的声音。
在很多东南军将士看来，陈必时执意留下来，除了鼓舞士气之外，肯定与东南军主动放弃南京有关。
要知道，这个时候，管远山已经是最高领导人了。
在从南京撤退的问题上，管远山一直持反对意见，甚至一度要求东南军战斗到最后一个人。虽然在最后的集体表决中，管远山做了让步，没有动用否决权，但是在会议上，管远山多次强调，要对南京失守追究责任。
说白了，就是要人出来背黑锅。
虽然连平民百姓都知道，东南军在南京拼尽了全力，近三十万官兵永远留在了这块战场上，还有数十万军民流下了鲜血，守不住南京是实力不如敌人，而陈必时在这场战役中并没有犯什么错误，也就没有理由背黑锅，但是现实却是，管远山初掌大权就遭受如此重大的失败，肯定要个说法，以树立自己的威信，因此就会拿南京失守大做文章，利用打击陈必时来打压最高统帅部里那些与他对抗的领导人。
正是如此，东南军将士才相信，陈必时已经做好了必死的准备。
不走，不是不想走，而是不想回去受辱。
虽然这只是无端猜测，但是在没有人出来证实的情况下，这种猜测很快就蔓延开来，甚至对东南军的士气产生了很大的影响。
十月十四日，轮到正规军的伤员撤往长江北岸。
也就在这天上午，第一批伤员在到达下关区的渡口之后，拒绝登船，而是拿出了用鲜血写成的万言书，要求留下来与南京共存亡。
伤员一闹，事态很快就扩大了。
受此影响，陈必时不得不立即赶往渡口，给情绪激动的伤员做思想工作，让他们搭上渡轮，前往长江北岸。
如果陈必时不来，也许伤员闹一闹，火气发泄了就会冷静下来。
陈必时一来，反而使问题激化了。
当时就有伤员提出，如果陈必时不走，他们就不走。
几经安抚没有产生作用之后，陈必时不得不下令，让警卫部队把伤员押上船，强行送往长江北岸。
问题是，后面还有几万伤员，总不可能全部用枪押着上船吧。
事实上，经伤员一番折腾之后，陈必时留守南京南岸的事情也引起了高层注意。
当天，刘诚志就再次给陈必时打了电话，要他立即前往长江北岸的战区司令部，履行战区司令官的职责。
可惜的是，陈必时仍然没有把刘诚志的话听进去。