五千川军赶赴朝鲜，被任命为副总兵。
日军大部分主力向南退却至釜山一带，两周之后，明军主力推进至庆州。日军自上年登陆釜山入侵朝鲜，至此全军减员四万余众。
明朝“征倭大军”在入朝作战数月之内，攻城掠地，横扫千里，除全罗道和庆尚道等沿海地区为日军所占外，成功收复朝鲜大半国土。
此后陆战主要集中于朝鲜南部地区进行，战斗双方以朝鲜勤王军与日军为主。6月中旬，日军攻打南部从城镇晋州，加藤清正、黑田长政分别派出本军悍将，以龟甲车攻毁城墙之薄弱部分，打开缺口之后，日军蜂拥攻入城内，朝鲜守将自杀殉国，晋州再次沦陷。 电子书 分享网站
六 日军陷入全线被动（3）
与陆军的作战不利相反，朝鲜水军却是连连获胜。
由于日本军团后勤给养发生严重困难，在朝日军统帅宇喜多秀家多次向名护屋发出告急信。九鬼嘉隆又率领三支舰队同时增援日军。
7月7日，李舜臣得到日本舰队停靠在见乃梁的情报，但因该海域过窄，朝鲜板屋船很难调动方向，加上日舰一旦势弱，很有可能逃窜，李舜臣最终决定将日舰引至开阔水域予以歼灭。
第二天，李舜臣率几艘船只前去诱敌，其他舰队在闲山岛海域设伏。朝鲜小股舰队诱敌成功后，撤退到达预定地点后，与朝鲜主力舰队汇合。李舜臣登临旗舰，展开鹤翼阵形攻击敌舰，把日本舰队成功包围，并率先攻打日军旗舰，大部分的日本战船还没来得及接近朝鲜舰队，就被火炮击沉海底，在这场战役中，朝鲜以五十四艘舰只对战日舰七十三艘，结果日方共损失五十九艘，朝鲜舰队则毫无半点损失。
闲山岛海战被世界著名海洋历史学家马汉写入《海权论》，并成为名震世界的著名海战案例。
闲山岛海战之后，李舜臣率领新编水军在南部海域展开还击，使得丰臣秀吉“水陆并进”全面落空，日军输送后续兵力和粮食辎重至朝鲜半岛的企图被有力遏制。
李舜臣的龟船舰队一个多月的时间先在玉埔海面击沉击伤了日本水军战船近五十艘，朝鲜水军仅仅一人轻伤；随后又转战露梁海面连破日军龟井兹矩的补给舰队，击毙龟井兹矩，并将九鬼嘉隆水军的主力舰队完全摧毁。
自从日军登陆之后，朝鲜水军就在全罗道左水使李舜臣的率领下展开一连串反击，在明军驰援朝鲜的同时，朝鲜水师在海面上已获得大半制海权。
明军援朝部队虽然收复了朝鲜大半国土，但是本军也付出巨大代价，明朝国内也是不堪重负。特别是碧蹄馆一战，虽然明军有力地粉碎了日军的北进意图，但也使得明军看到了日军的强大战斗力。
朝鲜政府当然不愿意看到明军推进发生迟疑，在朝鲜大臣王德完给国王的上疏中抱怨道：“（碧蹄馆战后，明军）魄散胆破，乃悚心坚意，惟封贡是图，不复言战斗事矣。”
明军是否真的是“魄散胆破”了？朝鲜大臣说了不算，他们一心想的是请“上国天兵”火速收复失地，但是兵饷粮草、损兵折将这样的战争代价却要“上国”自己全部担负，个中难处，朝鲜大臣不可能有切肤之感，他们的切肤之痛是沦丧国土于“倭贼”，其复仇心理应该理解，但明朝方面也有自己的现实困厄。
明朝兵科右给事中侯庆远也给万历皇帝上疏道：“我与倭何仇，为属国勤数道之师，力争平壤，以权收王京，挈两都授之，存亡兴灭，义声赫海外矣。全师而归，所获实多。”在明朝内部，也有部分官员认为明朝作为宗主国，征国内数道之师，劳民伤财，远赴属国，如今已经帮助朝鲜人民收复了平壤、王京等战略要地，可以说已经仁至义尽，剩下的事情就需要朝鲜自己去完成了。
但在朝明军将领却表达了不同意见