掌控者，大到对清作战制海论的制定、联合舰队的建立、“六六舰队”和“八八舰队”的提出，小到老旧军官的退役，吊床号制度的推行，对清“定”、“镇”两舰用速射炮取胜、启用伊东祐亨、东乡平八郎担任舰队司令，无不鲜明的带有他的个人特色。；
在山本权兵卫担任海军省官房主事时，在他主导下便成立了相对独立于海军省（军事行政机关）的海军军令部（参谋机构），使落后于陆军的海军有了和陆军平等的地位。在同时进行的人员调整过程中，他把同乡、前辈以及在明治维新中立过功的人也列为调整对象，解除了8个将军和89个校官的职务。那时山本权兵卫的桌上常常放着一把短刀，他在桌前挨个接见名单上的军官，向他们宣布“下岗”决定。不管是“僭上反乱”的怒吼还是苦苦哀求，山本权兵卫都毫不为之所动，铁石心肠地完成了日本海军史上的第一次“瘦身行动”。他对有用的人才能够毫无偏见地录用。象东乡平八郎、斋藤实、冈田启介、山下源太郎等日后成为重要角色的人物都是在那时由山本权兵卫提拔起来的。他的政治手法得到出身陆军的山县有朋和井上馨的赏识。当时身为萨摩人的山本权兵卫就认识到了“任人唯亲”的弊害，所以就用军校学习成绩来定升降的办法，推行吊床号制度，保证了“任人唯贤”，从而在很大程度上缓解了萨摩出身独霸日本海军的现象。
山本权兵卫在由萨摩派阀掌握主导权的日本海军中比同是萨摩藩出身的黑田清隆、西乡从道等人年轻十多岁，其实属于第二代领袖。但由于他有着被称为“权兵卫大臣”的实力背景，所以从1898年11月至1906年1月，曾连续担任三届内阁的海军大臣，成为海军的中心人物。
本来日本海军的地位一直不如陆军，从万年老2慢慢地爬到能和陆军老大几乎平起平坐可以说是非常不容易的，到第一次世界大战前，日本陆军除了还有一个名义上是“天皇的幕僚长”的参谋本部总长之外，再没什么比海军牛的地方了。海军的名声加上漂亮的军服，一直是日本青年人的向往，再加上男人那种天生的对机械的憧憬，使得土头土脑的日本陆军一度害怕招不到人了。从日俄战争结束开始，一高（后来的东京大学），陆军士官学校和海军兵学校这三个学校中，海军兵学校成了最难考的学校。但在两次“征支”战争和第一次世界大战中，日本海军无一例外的遭到了惨败，尤其是在“釜山海战”中竟然被中国海军打得几乎全军覆没，可以说颜面丧尽，成为了国人唾骂和讥讽的对象。
由于在两次“征支”战争中损失了大量的舰艇，日本海军本身也进入到了严重的“失血期”，加上对中国海军拥有的十二艘五万吨巨舰的恐惧（当年“定远不沉”的恐惧症又回来了），日本朝野上下在对海军在战争中的表现鄙夷不已的同时，要求“改革”海军（同时也是扩充海军）的呼声日高。
是 由，
（三百三十九）“瞒天过海”计划
但对山本权兵卫来说，继续扩充海军对日本来说已经成为了真正的梦魇。
日本在1919年到1922年这段时间里，每年的海军军费开支都占到了国家预算的25以上，再加上陆军的军费，军事预算占到了国家预算的将近一半，这完全是战争时期的财政预算。海军军备的扩充，有国力的因素，有造船能力和技术的因素，最后还有重工业体系的整体因素。而日本在这几个因素里面除了造船技术的项目主要是取决于熟练工人的技术度这一项和其他国家能够相比之外，其他诸要素全部拿不出手。长此而往，国家经济是根本承受不起的，国民也是难以负担的。
面对已经初具规模的“八八舰队”，现在的山本权兵卫其实并没有什么满足感，反而开始了烦恼，因为“八八舰队”这个日本人的梦想太过奢侈，不是缺少资源的