沟通达到天人和一的境界，这和忍者追求的极限体术不谋而合。
密宗视大日如来为万物之主，极力推崇传承、真言和密咒。我们在一些影视作品或者漫画中经常可以见到忍者做出许多古怪的手势，那便是在表述东密主要修法之一的“九字秘印”：“临、兵、斗、者、皆、阵、列、在、前”这九字真言。
技能训练：忍者家族的小孩不论男女，都必须继承祖先的职业传统，一般从五岁开始就接受训练。训练的种类有五种，即平衡、灵敏、力量、持久及特殊技巧。
平衡训练从走竹竿开始，当能够在滚圆的竹竿上行走而不滑下，就将竹竿逐渐升高，最终要升到三四十尺高，达到奔跑跳跃如履平地的境界，这样就能在树上、屋顶及墙头上下攀援，行走如飞。
灵敏的训练也是如此跳过插着刀片的绳子，在布满利刃、枪尖的狭道中拐弯抹角急速穿行。持久及力量的训练最为艰苦，如双手挂在树上，支持全身，下面放满暗器，不容你松手跳下，以恐惧来激发体内的潜能作长久的支持。
长跑更是忍者的基本功，要求连续跑上五十公里路而不停下来休息，日行百里是家常便饭。至于特殊技巧训练就更令人吃惊。除了上述说过的，还有徒手搏斗，投毒解毒等。化装术更是忍者的特长，他们能制造人*皮假脸，改换性别。让一个忍者在人群中穿行，由几个人在一旁辨认，结果各人所见都不相同，高矮胖瘦，不一而足，真可谓〃千面人〃。还有隐身术，比如忍者在烟雾中突然消失就是一种，那是忍者事先挖好的一个地洞，然后趁着烟雾掩护跳入地洞，令追捕者失去目标，以为真有〃隐身术〃。
体质训练：忍术对于身体训练的强度也是非常残忍的。忍术所包括的内容，每一项忍者都必须精通。并且每项训练，都全是死亡淘汰赛，无法承受的人是不允许生存的。除了常规训练外，忍术还包括多种“怪力训练”，忍者通过它进一步磨练意志，忍耐力，生存能力等等。
这种怪力训练诸如连续数天不食不动，杀死自己的同伴，以及与猛兽搏斗等，是令人难以想象的。通过这些死亡率极高毫无人性的修行，忍者从精神到**都实现了超人的飞越。获得了超越常人的毅力、耐力、战斗力。
通过忍术的训练而幸存的忍者，个个都是一部绝对可靠的全功率战斗机器。
忍者的武功与当时日本武士的武功有根本的区别，忍者由于执行任务的特殊，通常不用倭刀或者长矛，而使用便于携带的短兵器和暗器。
传说明朝中原武林曾出现过一种叫“八角菱”的暗器，乃是纯钢打造，利如刀，薄如纸，大小不过两寸，散射出来如漫天花雨，且“八角菱”上喂有剧毒，极有可能是来自日本忍者之手。而忍者的徒手搏击也是一绝，十根手指如钢似铁，穿胸破腹，撕颈裂头，瞬间使人至死，虽然不及中原武术博大精深，但实用性强。
忍者的居所也同样神秘莫测，处处机关暗通，这是为了防范其他割据势力手下忍者的威胁。往往从外表上看来只是一间普通的民宅，但是座位旁边的地板下一般安有转轴，当有敌人闯进住宅时，只需轻拍木板，背面立即翻转，露出兵器，操刀应战。顶蓬的木板往往也是活动的，拉下来便是折叠的楼梯，便于隐藏自己或逃跑。
东瀛扶桑传统的房门是拉门，正面容易被人堵截，且出入时声音较大，所以忍者的房门是转门，可以不露声色，出其不意反攻对方。墙板上则处处有暗门，或用于逃跑，或暗藏兵器，有一间甲贺流忍者房间墙内竟有十七个暗孔，三十多种不同的兵器，简直是个隐形的兵器展柜。
忍术的理论基础乃是由圣朝传来扶桑的孙子兵法而来，之后再加上扶桑人自己的修练道，以及在扶桑山民在山中的伏击技巧等发展融合而成。
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