根轴上的一系列转子，以及一个每次按键后就会是一个或几个转子旋转的联动装置。
每次按键后最右边的转子就会旋转，有时候也会带动相邻的转子旋转，转子的持续旋转就会造成每次按键后得到的加密字母都不一样。
而机械系统这样运作的原因则是为了产生不同的电流通路，，字母的加密则由机器自动完成。转子上装有金属的触点。这些金属触点连接到相邻的转子的触点上最终形成一条完整的电路，当一个按键被按下后。电流就会流过这条线路，最终点亮其中一个灯。这个灯显示的就是加密后的字母，每一次转子旋转都会联通不同的线路，转子越多、旋转的次数越多，线路变更的就越复杂，这样持续的线路变更就会让密码的破译变得更困难，从而带来极高的保密性。
并且为了进一步提高保密性，迷还安装了可以允许操作员手动设置不同线路的接线板，接线板能够让电流进入转子后改变它原本会经过的通过金属触点连接起来的线路，接线板的使用相当于让迷多了不止一个转子，如果说没有接线板的转子机还能够通过数学计算的方式通过人工破译，那么使用了接线板后，想要破译就需要借助特殊的计算设备了。
而历史上恩尼格码机的一个巨大设计问题也被避免了，那就是反射器，它可以将最后一个转子的两个金属触点连接起来，将电流经过另一条线路倒回，这就使加密和解密的过程变得一致了，也许在使用上会带来一些方便，但是却给密码机带来了一个特性，那就是加密后得到的字母与输入的字母永远不会相同，这在概念学和密码学上都是一个严重错误，也成了二战中盟军破解德军密码的一个重要突破口之一。
谢尔比乌斯自己设计的恩尼格码a型和b型上也没有反射器，只不过作为商业用途的c型为了考虑使用性，在1926年由谢尔比乌斯的同事威利？科恩设计并安装了这个玩意。现在德国人自然没有这个设计。
在操作步骤上现在德国人也采用的是历史上1940年以后的方式，因为转子机的的设置经常变动，但是转子的的起始位置却是每发送一条信息就要更换的，以防止以相同设置加密方式发送一定数量的信息后会被破译者找到规律。
但是最初德国人的操作步骤中存在一个巨大错误，那就是指示器步骤，他们会先按照密码本的记录来设置机器，然后随意输入3个字母，接着为了保险起见重新输入一遍，虽然输入的是3个字母，但是重复输入得到的却是6个不同的字母，然后再将转子调到他输入的那三个字母的模式上才开始输入原文。
但是这样做的结果是他将自己设置的输入模式打进了电文，另一方面出现了重复输入，这也是一个巨大的错误。一旦被摸清了规律，第三方将会立刻知道你的输入模式。
历史上马里安？雷耶夫斯基、杰尔兹？罗佐夫和亨里克？佐加尔斯基在1932年就能够破译早期恩尼格码加密的电文也是依靠这个错误作为突破口的。战时德国人改变了操作步骤，加上接线板的运用让恩尼格码的保密性提高了数个等级。
哪怕是一台只有3个转子的恩尼格码机都会拥有接近17000个组合，即使线路和一些设置被人所知，想要摸清规律也需要尝试1000次以上，因此想要靠人力使用穷举法来找出密码是完全不可能的。
只不过到了二战时期英国人投入的人力、物力和财力也不能同日而语，为此专门设计的炸弹机和巨像计算机等解码设备的投入更是大大提高了工作效率。
不过至少以一战的技术标准，迷几乎可以称得上是不可破译的，就算迷被缴获，以英法的技术实力也无法进行破译，历史上1931年法国人通过叛变的德国密码处工作人员施密特拿到过恩尼格码机的操作和内部线路资料，但是法国人依然无法破译恩